Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

5.3 Untersuchungen zum Vanillin-Metabolismus
LC-ESI-MS/MS analysiert. Von den 58 identifizierten Spots waren 49 unter Vanillin
induziert, 9 zeigten eine verminderte Expression (Tabelle 5.26).
Auch wenn sich die in GN235 unter Vanillin vermindert exprimierten Proteine teilweise
von den in P. putida KT2440 identifizierten unterschieden, deckten sich die in den beiden
Zuständen induzierten bzw. reprimierten Stoffwechselwege größtenteils. Wodurch
der Knockout des Enzyms Vanillin-Dehydrogenase (Vdh) kompensiert wurde, ließ sich
aus den Daten dieses Experiments nicht ableiten.
5.3.2 Analyse des Membranproteoms
Die vor der 2D-DIGE-Analyse durch Ultrazentrifugation abgetrennte Membranfraktion
wurde auch in diesem Experiment mittels labelfreier massenspektrometrischer Quantifizierung
untersucht.
Abbildung 5.24: Verteilung der während der Analyse der Membranfraktion identifizierten
Proteine auf die einzelnen subzellulären Kompartimente.
Der höhere Anteil zytosolischer Proteine in der Mutante P. putida GN235 lässt sich vermutlich
durch eine geringere Effizienz der Carbonatextraktion in diesem Versuch erklären.
Die Verteilung aller in P. putida KT2440 und P. putida GN235 identifizierter Proteine
auf die einzelnen subzellulären Kompartimente ist in Abbildung 5.24 dargestellt. Tabelle
5.27 fasst die statischen Parameter der beiden Versuche zusammen.
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