Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim
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5.3 Untersuchungen zum Vanillin-Metabolismus<br />
ArcB aus P. aeruginosa (91% Sequenzidentität) und könnte somit in P. putida KT2440<br />
die Umwandlung von Citrullin zu Ornithin katalysieren.<br />
Auch mehrere am Abbau von Putrescin beteiligte Enzyme, welche laut Bandounas<br />
et al. (2011) ortholog zur Putrescin-Aminotransferase (SpuC) aus P. aeruginosa<br />
sind, konnten in unseren Versuchen identifiziert werden. Dabei waren die Aminotransferase<br />
PP_5182 sowie das hypothetische Protein PP_3718 unter Vanillin induziert.<br />
Das hypotetische Protein PP_4421 war entgegengesetzt reguliert. In unmittelbarer<br />
Nachbarschaft zu dem am stärksten induzierten Putrescin Transportsystem (PP_1484,<br />
PP_1486) liegt das Gen PP_1481, welches für das Enzym γ-Aminobutyraldehyd-<br />
Dehydrogenase kodiert. Dieses Enzym katalysiert die Umwandlung von 4-Aminobutyraldehyd<br />
zu 4-Aminobutyrat (GABA) und war unter Vanillin induziert.<br />
Einige der Enzyme, welche weitere Schritte des Putrescin-Abbaus katalysieren könnten,<br />
wurden zwar identifiziert, zeigten in unserem Experiment jedoch keine Regulation.<br />
Auch der von Bandounas et al. (2011) in Pseudomonas putida S12 postulierte<br />
„γ-Glutamylation“-Weg war bis auf die beiden Glutamin-Synthetasen PP_5183 und<br />
PP_5184 nicht reguliert. Ob die Induktion dieser beiden Enzyme tatsächlich auf den<br />
Putrescin-Abbau zurückzuführen ist, oder doch auf einer Induktion der Glutaminsynthese<br />
aus Glutamat beruht, lässt sich anhand der vorhandenen Daten nicht sagen. Die<br />
Regulation der in diesem Abschnitt beschriebenen Proteine in den einzelnen durchgeführten<br />
Experimenten ist in Tabelle 5.34 zusammengefasst.<br />
Tabelle 5.34: Übersicht über die regulierten Proteine, welche mit dem Putrescin-<br />
Metabolismus in Verbindung stehen.<br />
Locus-Tag Gen Protein Reg.<br />
Reg.<br />
Reg.<br />
Reg.<br />
1D<br />
Mem<br />
2D<br />
In<br />
PP_0999 arcC carbamate kinase 9,9 - 4,8 Van<br />
PP_1000 argI ornithine carbamoyltransferase 7,6 - 5,4 Van<br />
PP_1001 arcA arginine deiminase 8,2 - 5 Van<br />
PP_1002 arcD arginine/ornithine antiporter 173 28,4 - Van<br />
PP_5182 aminotransferase 5,1 - - Van<br />
PP_5183 glutamine synthetase 2,4 - - Van<br />
PP_5184 glutamine synthetase 2,4 - - Van<br />
PP_0382<br />
Nitrilase/cyanide hydratase and<br />
apolipoprotein N-acyltransferase<br />
4 - - Van<br />
PP_3718 hypothetical protein 15,8 - - Van<br />
PP_4421 hypothetical protein 2,3 - - Glu<br />
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