Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

5.2 Untersuchungen zum Butanol-Metabolismus
Tabelle 5.13: Übersicht über die im Rahmen der Analyse des Butanol-Metabolismus durchgeführten
Membranproteom-Analysen.
Stamm Behandlung Features Features
MS/MS
Ident.
Reg.
(nach Filter)
Proteine
Proteine
KT2440
0,75 g/l
BuOH
36689 22807 10828 435 23
KT2440 7,5 g/l BuOH 45368 28009 13862 530 80
KT2440
0,75 g/l vs
7,5 g/l BuOH
45103 29097 13461 598 54
Features: Anzahl der insgesamt detektierten Features (Peptide).
(nach Filter): Features, welche nach dem Filtern mit den in Kapitel 4 angegeben Parametern in
der Analyse verblieben (Ladungszustand +2,+3,+4, MW 200 - 1800 Da).
MS/MS: Zahl aufgenommener MS/MS-Spektren.
Die Zusammensetzung der Membranfraktion in Hinblick auf die Lokalisation der identifizierten
Proteine ist in Abbildung 5.14 dargestellt.
Abbildung 5.14: Prozentuale Verteilung der während der Analyse der Membranfraktion in
den verschiedenen durchgeführten Vergleichen identifizierten Proteine auf die unterschiedlichen
subzellulären Kompartimente.
Es fällt auf, dass im Vergleich zu den im Schüttelkolben durchgeführten Experimenten,
der Anteil an zytosolischen Proteinen in den Membranfraktionen dieser Versuche
deutlich erhöht war. In den einzelnen durchgeführten Vergleichen waren die Anteile
weitgehend konstant. Obwohl sich das verwendete Protokoll zur Probenvorbereitung in
den beiden Versuchen nicht unterschied, war die Anreicherung von Membranproteinen
in den aus dem Bioreaktor gewonnenen Proben offenbar weniger erfolgreich. Das Ge-
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