Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim
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5 Ergebnisse<br />
Differenzielle Regulation von Proteinen in Pseudomonas putida KT2440 nach<br />
Behandlung mit Ethylenglycol (EG)<br />
Um einen Überblick über die in diesem Experiment regulierten Proteine zu geben,<br />
wurde ein Auszug aus den Ergebnissen und deren Vergleich mit anderen untersuchten<br />
Zuständen und Stämmen in Tabelle 5.2 zusammengefasst.<br />
Tabelle 5.2: Auswahl regulierter Proteine nach Behandlung mit EG und GXS in den verschiedenen<br />
untersuchten Stämmen. Alle Regulationsfaktoren wurden den mit diesen Stämmen<br />
durchgeführten 2D-DIGE-Experimenten entnommen. Wurde ein Protein in mehreren Spots detektiert,<br />
ist in der Tabelle der Regulationsfaktor des am stärksten regulierten Spots angegeben.<br />
Proteine wurden als reguliert betrachtet, wenn sie um eine Faktor von 1,8 bzw. 0,6 reguliert<br />
waren und einen p-Wert 1 zeigen eine Induktion des<br />
Proteins in der mit GXS bzw. EG behandelten Proben an.<br />
KT2440 GN259 JM37<br />
Spot Protein EG GXS EG GXS EG GXS<br />
1 Isocitrat Lyase (AceA) 2,8 2,8 k.o. k.o. 1,9 -<br />
2 Glyoxylat Carboligase (Gcl) - - k.o. k.o. 9,6 16<br />
3 Malat Synthase G (GlcB) - - k.o. k.o. 3,7 17<br />
4 Quinoprotein Alkohol-Dehydrogenase (PedH) 21 n.a. n.a. n.a. n.a. n.a.<br />
5 Quinoprotein Alkohol-Dehydrogenase (PedE) 34 - 8,2 - 31 0,5<br />
6 Aldehyd-Dehydrogenase (PedI) 5,2 - - - 7,9 -<br />
7 Aldehyd-Dehydrogenase (PP_0545) - - 5,5 - 2 -<br />
8 Transkriptions-Regulator (PedR1) 4,8 - - - 4,8 -<br />
9 PAS/PAC Sensor Hybrid Histidin-Kinase<br />
(PedS1)<br />
7,7 - - - - -<br />
10 Acetyl-CoA Synthase (AcsA, PP_4487) 2,6 1,8 - 2,2 3,3 -<br />
11 Hypothetisches Porin (PP_2662) 31 - 15 - 34 -<br />
n.a.: Nicht analysiert (dieser pH-Bereich wurde in den entsprechenden Versuchen nicht erfasst).<br />
-: Das Protein war nach den angelegten Kriterien (Regulation > 1,8, bzw. < 0,6; p-Wert < 0,05)<br />
nicht reguliert.<br />
k.o.: Das entsprechende Gen war in diesem Stamm deletiert.<br />
Abbildung 5.2 zeigt darüber hinaus die Position der in Tabelle 5.2 aufgelisteten Proteine<br />
auf den 2D-DIGE-Gelen von P. putida KT2440 und P. putida JM37 nach Behandlung<br />
mit Ethylenglycol.<br />
Zu den nach Behandlung mit Ethylenglycol am stärksten induzierten Proteinen gehörten<br />
die beiden Alkohol-Dehydrogenasen PP_2674 (34-fach) und PP_2679 (21-fach). Eine<br />
ebenfalls starke Regulation zeigte das nicht näher charakterisierte Protein PP_2662<br />
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