Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

6.4 Vergleich der eingesetzten Methoden
einem Spot mit einer ähnlichen Anzahl an Peptiden identifiziert, wurden diese alle als
reguliert angesehen. Proteine welche in mehreren Spots identifiziert wurden, wurden in
beiden Abbildungsteilen nur einmal berücksichtigt.
Abbildung 6.3: Vergleich der im Rahmen des Vanillin-Teilprojekts eingesetzten Methoden
in P. putida KT2440.
A) Verteilung der regulierten Proteine auf die einzelnen subzellulären Kompartimente. B)
VENN-Diagramm zur Darstellung der Zahl regulierter Proteine und deren Schnittmengen
zwischen den eingesetzten Methoden. Die Gesamtzahl regulierter Proteine der jeweiligen Methode
ist in Klammern angegeben.
Der Vergleich der subzellulären Lokalisation zwischen den einzelnen Experimenten
zeigt, dass wie erwartet, der Anteil zytosolischer Proteine bei der 2D-DIGE-Analyse am
höchsten war. Die Membranfraktion weist dagegen prozentual betrachtet den höchsten
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