Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim
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5 Ergebnisse<br />
nisse der GeLCMSMS-Analyse (s. Abschnitt 5.2.3.3) zeigten, dass die kontaminierten<br />
Proben aus Fermenter III und IV stammten. Es ist davon auszugehen, dass in diesen<br />
Fermentern zusätzlich zu P. putida KT2440 auch eine Subpopulation von Paenibacillus<br />
sp. vorhanden war. Ob diese Kontamination einen Einfluss auf die in P. putida KT2440<br />
beobachtete Proteinregulation hatte, lässt sich nur schwer abschätzen.<br />
Differenzielle Regulation von Proteinen in Pseudomonas putida KT2440 im Vergleich<br />
zwischen Steady-State I und Steady-State III<br />
In diesem Experiment waren insgesamt 78 Spots differentiell reguliert, wovon 75 massenspektrometrisch<br />
identifiziert werden konnten. 38 dieser Spots waren in Steady-State<br />
I induziert, 37 in Steady-State III. Wie im vorherigen Experiment konnten auch hier<br />
einige Proteine in mehreren Spot nachgewiesen werden. Spots, welche wahrscheinlich<br />
unterschiedlich modifizierte Formen des Proteins enthielten, bildeten deutlich sichtbare<br />
horizontale Ketten.<br />
Auffällig in diesem Experiment war die Identifizierung der Alkohol- und Aldehyd-<br />
Dehydrogenasen (PedE, PedI) sowie der Isocitrat Lyase (PP_4116) in unterschiedlichen<br />
Molekulargewichtsbereichen des Gels. Dies würde für eine Degradation oder für eine<br />
gezielte Prozessierung (einen gezielten Abbau) der betroffenen Proteine in den analysierten<br />
Proben sprechen. Da die Regulation der entsprechenden Spots in allen Gelen<br />
identisch war und die Vorbereitung der Proben nach jeder Kultivierung erfolgte, ist<br />
eine Degradation der Proteine während der Probenaufarbeitung unwahrscheinlich.<br />
Differenzielle Regulation von Proteinen in Pseudomonas putida KT2440 im Vergleich<br />
zwischen Steady-State II und Steady-State III<br />
In diesem Vergleich konnten in 36 von 37 regulierten Spots ein oder mehrere Proteine<br />
identifiziert werden. 20 dieser Spots waren in Steady-State III nach oben, 16 nach unten<br />
reguliert. Generell konnten durch diesen Vergleich keine neuen Erkenntnisse gewonnen<br />
werden.<br />
5.2.3.2 Analyse des Membranproteoms<br />
Die differentielle Proteomanalyse der Membranfraktionen erfolgte wie bereits für die<br />
entsprechenden Analysen im Teilprojekt Ethylenglycol beschrieben (s. Abschnitt 5.1.2).<br />
Tabelle 5.13 gibt einen Überblick über die Eckdaten der durchgeführten Analysen.<br />
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