Forschungsarbeiten zum Thema Biodiversität aus den ... - Genres
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Nr. 031<br />
Sektor Landwirtschaft<br />
Stichworte mikrobielle Ökologie, Antibiotikaresistenzgene, mobile genetische Elemente, PCR-<br />
Detektion, exogene Isolierung<br />
Einrichtung und Institut BBA – Institut für Pflanzenvirologie, Mikrobiologie und biologische Sicherheit<br />
bzw. Abteilung<br />
Projekttitel Untersuchungen <strong>zum</strong> horizontalen Gen<strong>aus</strong>t<strong>aus</strong>ch<br />
Projektbeschreibung Horizontaler Gen<strong>aus</strong>t<strong>aus</strong>ch ermöglicht es Bakterienpopulationen, sich an wechselnde<br />
Umweltbedingungen anzupassen. Bakterielle Genome sind außeror<strong>den</strong>tlich plastisch,<br />
und diese Flexibilität wird vor allem durch mobile genetische Elemente wie Plasmide,<br />
Phagen, Transposons, Integrons / Genkassetten, aber auch Pathogenitätsinseln erleichtert.<br />
Wir untersuchen die Abundanz und Diversität von transferablen Antibiotikaresistenzgenen<br />
in Abhängigkeit vom Reservoir und der Belastungssituation. Derzeit untersuchen<br />
wir in einer DFG-Forschergruppe <strong>den</strong> Effekt von Veterinärmedikamenten auf die<br />
Abundanz und Diversität von Antibiotika-Resistenzgenen und mobilen genetischen Elementen.<br />
Antibiotika kommen über die Tiergülle in <strong>den</strong> Bo<strong>den</strong>. Der Verbleib und die<br />
möglichen Effekte von geringen Antibiotika-Konzentrationen sollen in der Forschergruppe<br />
geklärt wer<strong>den</strong>. Der horizontale Gentransfer durch Transformation (Aufnahme<br />
freier DNA) wird im Rahmen eines EU-Projekts untersucht. In diesem Projekt wollen<br />
wir <strong>zum</strong> einen her<strong>aus</strong>fin<strong>den</strong>, wie groß der Anteil von Bo<strong>den</strong>bakterien ist, die natürlich<br />
transformierbar sind. Zum anderen wollen wir her<strong>aus</strong>fin<strong>den</strong>, inwieweit die Transformation<br />
von Bo<strong>den</strong>bakterien durch die Nutzung von transplastomischen Pflanzen erhöht<br />
wird.<br />
Laufzeit DFGSM59-5 bis 2008; EU bis 2005; INTAS bis 2005<br />
Projektleiter / Ansprechpartner<br />
Zukünftige Entwicklung /<br />
Forschungsbedarf<br />
94<br />
Prof. Dr. Kornelia Smalla, Biologische Bundesanstalt für Land- und Forstwirtschaft,<br />
Institut für Pflanzenvirologie, Mikrobiologie und biologische Sicherheit, Messeweg<br />
11/12, 38104 Braunschweig, Tel.: 0531-2993814, Fax: 0531-2993013,<br />
k.smalla@bba.de<br />
Die methodischen Vor<strong>aus</strong>setzungen zur kultivierungsunabhängigen Untersuchung von<br />
Resistenzgenen oder mobilen genetischen Elementen ist noch sehr beschränkt. Auch<br />
hier ist der Einsatz neuer Metho<strong>den</strong> zur in situ-Detektion von horizontalen Gentransferereignissen<br />
sowie die Nutzung der Array-Technologie unser Ziel.<br />
Hinweise / Links http://www.tu-berlin.de/fb7/ioeb/bo<strong>den</strong>kunde/Forschung/Tierarznei/ tierarznei.html,<br />
http://www.transbac.org
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