Forschungsarbeiten zum Thema Biodiversität aus den ... - Genres

Nr. 034
Sektor Forstwirtschaft
Stichworte Kiefernholznematode, Bursaphelenchus xylophilus, Artenvielfalt, Risikoanalyse, molekulare
Analyse
Einrichtung und Institut BBA – Institut für Pflanzenvirologie, Mikrobiologie und biologische Sicherheit
bzw. Abteilung
Projekttitel Molekularbiologische Diagnosemethoden zur Identifizierung von Bursaphelenchus-
Arten und Herkunftsbestimmung eingeschleppter Kiefernholznematoden (B. xylophilus)
Projektbeschreibung Seit Auffindung des aus Übersee eingeschleppten Quarantäneschädlings Kiefernholznematode
(Bursaphelenchus xylophilus) 1999 in Portugal wurden in der EU die Kontrolle
von Holzimporten und das Monitoring von Bäumen und Waldbeständen in Risikogebieten
verstärkt. Im Rahmen des von der EU geförderten Projektes PHRAME werden molekulare
Diagnosemethoden entwickelt, um (1) eine sichere Identifizierung von B. xylophilus
und anderen Bursaphelenchus-Arten in Verdachtsproben zu gewährleisten und (2)
Informationen über Herkunft und Einschleppungsweg(e) der in Portugal etablierten Population(en)
des Kiefernholznematoden zu erhalten. Zur Artbestimmung wurde die ITS-
RFLP-Methode etabliert. Anhand artspezifischer ITS-RFLP-Bandenmuster können B.
xylophilus und etwa 30 weitere Bursaphelenchus-Arten identifiziert werden. Da weltweit
mehr als 70 Bursaphelenchus-Arten vorkommen, werden „molekulare Steckbriefe“ für
weitere Arten durch Kooperation mit Kollegen in anderen Ländern erstellt. Zur Herkunftsanalyse
werden RAPD- und ISSR-Techniken eingesetzt, die eine intraspezifische
Klassifizierung von B. xylophilus-Isolaten nach ihrer genetischen Verwandtschaft anhand
vieler DNA-Marker ermöglichen. Durch Clusteranalyse der Marker-Daten von 30 B.
xylophilus-Isolaten aus den USA, Kanada, Japan, China, Südkorea, Taiwan und Portugal
wurden genetische Distanzen berechnet, die mit den geographischen Distanzen der Herkunftsgebiete
korrelieren und Schlussfolgerungen über Herkunft und Verschleppungswege
der Nematoden erlauben.
Laufzeit 2003 – 2007
Projektleiter / Ansprechpartner
Zukünftige Entwicklung /
Forschungsbedarf
Dr. Wolfgang Burgermeister, Biologische Bundesanstalt, Institut für Pflanzenvirologie,
Mikrobiologie und biologische Sicherheit, Messeweg 11/12, 38104 Braunschweig, Telefon:
+49 (531) 2 99-38 02, Fax: +49 (531) 2 99-30 06, E-Mail: w.burgermeister@bba.de
Kooperationspartner: Dr. Thomas Schröder, BBA-AG
Identifizierung von Bursaphelenchus-Arten: Durch Sequenzierung der amplifizierten
ITS-Bereiche der ribosomalen DNA sollen genetische Beziehungen innerhalb von Bursaphelenchus-Artengruppen
(vor allem der phytopathologisch wichtigen xylophilus-
Gruppe) aufgeklärt werden.Verbesserung der Herkunftsanalyse: B. xylophilus-Isolate aus
allen Bereichen des portugiesischen Verbreitungsgebietes werden in die Clusteranalyse
einbezogen, um Informationen über die Zahl der Einschleppungen und die Ausbreitungswege
in Portugal zu erhalten. Durch Einbeziehung weiterer RAPD- und ISSR-
Marker wird die Genauigkeit der genetischen Gruppierung erhöht.
Hinweise / Links http://www.forestry.gov.uk/forestry/ggae-5rhgfr
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