Points saillants de la recherche canadienne sur les bovins laitiers ...

Génétique
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Déséquilibre de liaison et signatures de sélection sur les
chromosomes 19 et 29 des bovins de boucherie et des
bovins laitiers
Animal Genetics, decembre 2008, Volume 39, Nombre 6, pages 597-608
Corresponding Author
Moore, S.S.
University of Alberta
Collaborators
Prasad, A.
University of Alberta
Schnabel, R.D.
University of Missouri
McKay, S.D.
University of Alberta
Murdoch, B.M.
University of Alberta
Stothard, P.
University of Alberta
Kolbehdari, D.
University of Alberta
Wang, Z.
University of Alberta
Taylor, J.F.
University of Missouri
128 Points saillants de la recherche canadienne sur les bovins laitiers - 2009
Les gènes individuels porteurs du code génétique qui définit les
caractéristiques particulières d’un individu viennent par paires, chaque
gène étant situé sur l’un des deux chromosomes formant la paire.
Cependant, les gènes peuvent aussi prendre d’autres formes désignées
allèles. Si un gène a deux allèles, quatre combinaisons alléliques sont
possibles pour ce gène, soit AA, BB, AB et BA. Les allèles d’autres gènes
situés ailleurs dans le génome peuvent s’apparier de la même façon
pour former par exemple les combinaisons CC, DD, CD ou DC. S’il n’y
a pas de lien entre les deux gènes, la probabilité que chacune des
quatre combinaisons alléliques se produise pour chacun de ces gènes
est indépendante l’une de l’autre : on dit que les deux gènes sont en
équilibre de liaison. En revanche, si certaines combinaisons (p. ex.,
AA/CD) sont plus fréquentes que le nombre prévu par combinaisons
aléatoires, on dit alors que les deux gènes sont en déséquilibre de
liaison. Les différentes versions du code de l’ADN porté par chaque
allèle peuvent être caractérisées par les variations dans les nucléotides
présents à un point unique dans la séquence d’ADN (polymorphisme
mononucléotidique ou SNP). Les auteurs de la présente étude ont
examiné le degré de déséquilibre de liaison pour 370 SNP sur le
chromosome 19 et 186 SNP sur le chromosome 29 chez des bovins des
races Angus et Holstein. Ils ont constaté que le déséquilibre de liaison
devient non significatif lorsque les SNP sont séparés de plus de quelque
20 millions de nucléotides. Les « signatures » font référence aux régions
du génome où sont observées des variations concernant des caractères
importants sur le plan économique. La présente étude a relevé plusieurs
de ces signatures sur les chromosomes examinés.