Points saillants de la recherche canadienne sur les bovins laitiers ...

Génétique
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Élaboration et caractérisation d’un essai de génotypage des
SNP à haute densité chez les bovins
PLoS One, avril 2009, Volume 4, Nombre 4, pages 1-13
Corresponding Author
Van Tassell, C.P.
USDA Bovine Functional Genomics
Laboratory
Collaborators
Matukumalli, L.K.
George Mason University
Lawley, C.T.
Illumina Inc
Schnabel, R.D.
University of Missouri
Taylor, J.F.
University of Missouri
Allan, M.F.
USDA Meat Animal Research
Center
Heaton, M.P.
USDA Meat Animal Research
Center
O’Connell, J.
USDA Bovine Functional Genomics
Laboratory
Moore, S.S.
University of Alberta
Smith, T.P.L.
USDA Meat Animal Research
Center
Sonstegard, T.S.
USDA Bovine Functional Genomics
Laboratory
134 Points saillants de la recherche canadienne sur les bovins laitiers - 2009
La variation génétique entre les individus est due aux différences
dans les séquences de nucléotides qui forment leur ADN. La plupart
de ces différences se présentent sous forme de polymorphismes
mononucléotidiques (SNP), où un seul nucléotide est remplacé par
un autre. Pour quelques caractères, un SNP dans un seul gène peut
déterminer l’expression observable du caractère; pour la plupart des
caractères, toutefois, le niveau d’expression dépend d’un ensemble de
SNP compris dans un certain nombre de gènes pouvant être largement
distribués dans l’ensemble du génome. C’est ce qu’on appelle les
caractères quantitatifs, et les sites des gènes qui influencent ces
caractères sont désignés locus quantitatifs (QTL). Cet article décrit la
mise au point d’une méthode qui permet la caractérisation simultanée
de 54 000 SNP espacés assez également dans l’ensemble du génome
bovin. Cette méthode a été mise à l’essai pour l’analyse des génomes
(génotypage) de 576 animaux de 21 races bovines et six espèces
apparentées. L’analyse a révélé que de 39 765 à 46 492 SNP pourraient
donner lieu à plus d’une substitution possible de nucléotides à l’intérieur
d’une race donnée. La valeur de cette méthode a été démontrée
par la détermination des QTL responsables de la couleur de la robe
et de la présence ou de l’absence de cornes. La méthode décrite est
commercialisée sous le nom BovineSNP50 BeadChip, par l’entreprise
Illumina Inc.