Points saillants de la recherche canadienne sur les bovins laitiers ...

More documents

Recommendations

Info

Génétique 12 Élaboration et caractérisation d’un essai de génotypage des SNP à haute densité chez les bovins PLoS One, avril 2009, Volume 4, Nombre 4, pages 1-13 Corresponding Author Van Tassell, C.P. USDA Bovine Functional Genomics Laboratory Collaborators Matukumalli, L.K. George Mason University Lawley, C.T. Illumina Inc Schnabel, R.D. University of Missouri Taylor, J.F. University of Missouri Allan, M.F. USDA Meat Animal Research Center Heaton, M.P. USDA Meat Animal Research Center O’Connell, J. USDA Bovine Functional Genomics Laboratory Moore, S.S. University of Alberta Smith, T.P.L. USDA Meat Animal Research Center Sonstegard, T.S. USDA Bovine Functional Genomics Laboratory 134 Points saillants de la recherche canadienne sur les bovins laitiers - 2009 La variation génétique entre les individus est due aux différences dans les séquences de nucléotides qui forment leur ADN. La plupart de ces différences se présentent sous forme de polymorphismes mononucléotidiques (SNP), où un seul nucléotide est remplacé par un autre. Pour quelques caractères, un SNP dans un seul gène peut déterminer l’expression observable du caractère; pour la plupart des caractères, toutefois, le niveau d’expression dépend d’un ensemble de SNP compris dans un certain nombre de gènes pouvant être largement distribués dans l’ensemble du génome. C’est ce qu’on appelle les caractères quantitatifs, et les sites des gènes qui influencent ces caractères sont désignés locus quantitatifs (QTL). Cet article décrit la mise au point d’une méthode qui permet la caractérisation simultanée de 54 000 SNP espacés assez également dans l’ensemble du génome bovin. Cette méthode a été mise à l’essai pour l’analyse des génomes (génotypage) de 576 animaux de 21 races bovines et six espèces apparentées. L’analyse a révélé que de 39 765 à 46 492 SNP pourraient donner lieu à plus d’une substitution possible de nucléotides à l’intérieur d’une race donnée. La valeur de cette méthode a été démontrée par la détermination des QTL responsables de la couleur de la robe et de la présence ou de l’absence de cornes. La méthode décrite est commercialisée sous le nom BovineSNP50 BeadChip, par l’entreprise Illumina Inc.
13 Génétique L’étude de la variation du SNP sur tout le génome informe sur la structure génétique des races bovines Science, avril 2009, Volume 324, Nombre 5926, pages 528-532 Corresponding Author Moore, S.S. University of Alberta Collaborators Plastow, G. University of Alberta Murdoch, B.M. University of Alberta Lynn, D.J. Simon Fraser University Des chercheurs ont récemment établi la séquence complète des nucléotides dans l’ADN (génome) de plusieurs espèces animales. Bien que la grande majorité des nucléotides présents à des endroits précis (locus) du génome soient communs à différentes espèces, des mutations ont donné lieu au remplacement d’un nucléotide par un autre à des locus spécifiques. Ces substitutions entraînent à ces locus des variations nucléotidiques entre des espèces, ainsi qu’entre des individus d’une même espèce, un phénomène désigné sous le nom de polymorphisme mononucléotidique ou SNP(prononcer « snip »). La présente étude décrit des travaux visant à caractériser les SNP parmi les races bovines. Des méthodes ont été mises au point pour déceler les différences entre les nucléotides présents à 37 470 locus de SNP dans le génome de 19 races. Les résultats laissent croire que la domestication et la sélection en fonction de caractères importants sur le plan économique (p. ex., la production de lait et la résistance aux maladies) ont entraîné une diminution de la diversité parmi ces races. Cette étude a aussi mis en lumière un certain nombre de régions de « signature » dans le génome – c.-à-d. des séquences d’ADN relativement stables résultant de la sélection en fonction de caractères favorables, communs à toutes les races. Les auteurs notent que la diversité génétique à l’intérieur des races n’est pas inférieure à celle observée dans la population humaine. NOTA : Faute d’espace, seuls les noms des chercheurs canadiens qui ont participé à cette étude du Consortium HapMap sont mentionnés ici; ce consortium réunit 150 membres. Génétique 135
Page 1 and 2:
Points saillants de la recherche ca
Page 3:
Table des matières Introduction ..
Page 7 and 8:
Agriculture et Agroalimentaire Cana
Page 9 and 10:
University of Alberta, Edmonton AB
Page 11 and 12:
Collaborateurs internationaux Insti
Page 13:
Utrecht University, Utrecht, The Ne
Page 16 and 17:
Index des résumés Environnement C
Page 18 and 19:
Index des résumés Effet du ratio
Page 20 and 21:
Santé Index des résumés Comparai
Page 22 and 23:
Index des résumés Production lait
Page 25:
Bien-être animal
Page 28 and 29:
Bien-être animal 2 Évaluation de
Page 30 and 31:
Bien-être animal 4 Impact du mélo
Page 32 and 33:
Bien-être animal 6 Utilisation de
Page 34 and 35:
Bien-être animal 8 La méthode d
Page 36 and 37:
Bien-être animal 10 La position de
Page 38 and 39:
Bien-être animal 12 Variation du c
Page 40 and 41:
Bien-être animal 14 La concurrence
Page 42 and 43:
Bien-être animal 16 La propension
Page 44 and 45:
Bien-être animal 18 La concurrence
Page 46 and 47:
Bien-être animal 20 Latéralité d
Page 48 and 49:
Bien-être animal 22 Évaluation de
Page 50 and 51:
Bien-être animal 24 Mesure automat
Page 53 and 54:
1 Environnement Comparaison des imp
Page 55 and 56:
3 Environnement Ajout de Yucca schi
Page 57:
5 Stratégies alimentaires pour ré
Page 61 and 62:
1 Alimentation Valeur protéique d
Page 63 and 64:
3 Alimentation Relations entre l’
Page 65 and 66:
5 Alimentation La luzerne récolté
Page 67 and 68:
7 Effets des suppléments d’histi
Page 69 and 70:
9 Alimentation Concentration fécal
Page 71 and 72:
11 Alimentation Études sur la prod
Page 73 and 74:
13 Alimentation Méta-analyse de l
Page 75 and 76:
15 Alimentation Prédiction empiriq
Page 77 and 78:
17 Alimentation Effets des supplém
Page 79 and 80:
19 Alimentation Effets des supplém
Page 81 and 82:
21 Alimentation Effets sur la ferme
Page 83 and 84: 23 Alimentation Suppléments de lev
Page 85 and 86: 25 Alimentation La luzerne récolt
Page 87 and 88: 27 Alimentation Translocation de li
Page 89 and 90: 29 Alimentation Caractérisation ch
Page 91 and 92: 31 Alimentation Augmentation de la
Page 93 and 94: 33 Influence de l’administration
Page 95 and 96: 35 Alimentation Utilisation de l’
Page 97 and 98: 37 Alimentation Effets du glycérol
Page 99 and 100: 39 Alimentation Utilisation d’un
Page 101 and 102: 41 Alimentation Effets d’un addit
Page 103 and 104: 43 Alimentation Effet des sources d
Page 105 and 106: 45 Alimentation Effets du glucose,
Page 107 and 108: 47 Alimentation Le fait d’augment
Page 109 and 110: 49 Alimentation Analyse par microsp
Page 111 and 112: 51 Alimentation Effets de l’augme
Page 113 and 114: 53 Alimentation L’effet de la sub
Page 115 and 116: 55 Alimentation Synthèse ruminale
Page 117 and 118: 57 Alimentation Effets de l’acide
Page 119 and 120: 59 Alimentation Variation et assimi
Page 121: Génétique
Page 124 and 125: Génétique 2 Évaluation des carac
Page 126 and 127: Génétique 4 Analyse critique des
Page 128 and 129: Génétique 6 Déséquilibre de lia
Page 130 and 131: Génétique 8 Réactions immunitair
Page 132 and 133: Génétique 10 Analyse phénotypiqu
Page 136 and 137: Génétique 14 Effet de l’ajustem
Page 138 and 139: Génétique 16 Analyse du génome c
Page 140 and 141: Génétique 18 Paramètres généti
Page 142 and 143: Génétique 20 Modélisation de la
Page 144 and 145: Génétique 22 Le génotype de la s
Page 147 and 148: 1 Santé Comparaison de la culture
Page 149 and 150: 3 Prévalence au niveau du troupeau
Page 151 and 152: 5 Santé Caractérisation d’une v
Page 153 and 154: 7 Santé Comparaison de mesures d
Page 155 and 156: 9 Santé Facteurs de risque liés
Page 157 and 158: 11 Santé Comparaison des résultat
Page 159 and 160: 13 Santé Évaluation du test calif
Page 161 and 162: 15 Santé Prévalence et facteurs d
Page 163 and 164: 17 Santé Facteurs associés au ris
Page 165 and 166: 19 Santé Spécificité et sensibil
Page 167 and 168: 21 Santé Examen échographique du
Page 169 and 170: 23 Santé Évaluation des concentra
Page 171 and 172: 25 Santé Prévalence et caractéri
Page 173 and 174: 27 Valeurs seuils des substances bi
Page 175 and 176: 29 Santé Les neutrophiles, l’une
Page 177 and 178: 31 Évaluation en laboratoire des s
Page 179 and 180: 33 Santé Efficacité des systèmes
Page 181 and 182: 35 Santé Cinétique et résidus ap
Page 183 and 184: 37 Santé Facteurs de risque liés
Page 185 and 186:
39 Santé Relation entre les résul
Page 187 and 188:
41 Santé Distribution de probabili
Page 189 and 190:
43 Santé Association entre les SNP
Page 191 and 192:
45 Santé Relations entre, d’une
Page 193 and 194:
47 Santé Caractéristiques des tau
Page 195:
49 Santé Fiabilité du comptage de
Page 199 and 200:
1 Production laitière Taux sériqu
Page 201 and 202:
3 Production laitière Contrôle lo
Page 203 and 204:
5 Production laitière Analyse de l
Page 205:
Reproduction
Page 208 and 209:
Reproduction 2 Développement mamma
Page 210 and 211:
Reproduction 4 Effets d’un éclai
Page 212 and 213:
Reproduction 6 Rôle du facteur de
Page 214 and 215:
Reproduction 8 Évaluation du test
Page 216 and 217:
Reproduction 10 Prolifération et c
Page 218 and 219:
Reproduction 12 Expression spatiote
Page 220 and 221:
Reproduction 14 La température tes
Page 222 and 223:
Reproduction 16 Découverte du tran
Page 224 and 225:
Reproduction 18 La culture in vitro
Page 226 and 227:
Reproduction 20 Modulation des sign
Page 228 and 229:
Reproduction 22 Effets des densité
Page 230 and 231:
Reproduction 24 Le facteur de crois
Page 232 and 233:
Reproduction 26 Anoestrus postpartu
Page 234 and 235:
Reproduction 28 Le peptide BH4 dér
Page 236 and 237:
Reproduction 30 Taux de conception
Page 238 and 239:
Reproduction 32 Caractérisation de
Page 240 and 241:
Reproduction 34 Régulation et acti
Page 242 and 243:
Reproduction 36 Écart de l’expre
Page 245 and 246:
Index des participants Participant
Page 247 and 248:
Page 249 and 250:
Page 251 and 252:
Page 253 and 254:
Page 256:
Réseau laitier canadien Canadian D
show all

Points saillants de la recherche canadienne sur les bovins laitiers ...

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?