Protein ? Disassembly im Verlauf der endosomalen Prozessierung
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Ergebnisse Seite 109<br />
hohe Homologie in <strong>der</strong> Bindungsgruben - Domäne ist auf den l<strong>im</strong>itierten Polymorphis-<br />
mus <strong>der</strong> α-Kette zurückzuführen. Starke Unterschiede zeigen sich in den murinen I-E<br />
undRattenRT1DundzudenmurinenI-AundRattenRT1B-SequenzenandenAmino-<br />
säurepositionen 2-25. Hier sind die Sequenzen <strong>der</strong> ersten Gruppe zueinan<strong>der</strong> sehr<br />
ähnlich, unterscheiden sich aber deutlich von denen <strong>der</strong> zweiten Gruppe. Dies ist auf<br />
die unterschiedlichen Isotypen zurückzuführen. HLA-DR, I-E und RT1D stellen den ei-<br />
nen, HLA-DQ, I-A und RT1B den an<strong>der</strong>en Isotyp dar<br />
In einem weiteren Alignment wurden die β - Ketten <strong>der</strong> MHC Klasse II - Moleküle mitein-<br />
an<strong>der</strong> verglichen. Wie <strong>der</strong> Stammbaum <strong>der</strong> Sequenzen bereits andeutet, gibt es <strong>im</strong> Ver-<br />
gleich zu den α - Ketten Unterschiede in den Ähnlichkeiten <strong>der</strong> Sequenzen zueinan<strong>der</strong>.<br />
Die Abb. 30 zeigt das Alignment <strong>der</strong> MHC Klasse II β - Ketten.<br />
Abb. 30 Sequenzalignment <strong>der</strong> Template MHC Klasse II β-Ketten mit dem<br />
löslichen Anteil <strong>der</strong> Lewis RT1.Bl bzw. RT1.Dl Sequenz<br />
Das Alignment wurde mit ClustalX erstellt. Blau gekennzeichnete AS geben identische Bereiche<br />
wie<strong>der</strong>, grün homologe Bereiche. Grüne Pfeile symbolisieren Faltblattstrukturen, orange Helices
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