Ergebnisse Seite 129 det. Die Aminosäuren PRO95 und LEU97 bilden keinerlei Wasserstoffbrücken mit dem RT1.B l – Molekül aus. 3.2.8 Intermolekulare Wechselwirkungen zwischen RT1.B l und CLIPm Ein Vergleich <strong>der</strong> molekularen Wechselwirkungen von CLIPm und CLIP mit dem RT1.B l – Molekül sollte erste Aufschlüsse über die verän<strong>der</strong>te Bindungsaffinität <strong>der</strong> beiden Peptide ermöglichen. AS Atom Wasserstoff- Brücke tide ermöglichen. van <strong>der</strong> waals Kontakte SER88 N LEU α51 O SERα53, GLYβ84A,GLNα50 O SER α53 N SERα53, GLYβ84A, LEUα51 OG GLY β84A O LEUα51,, GLYβ84 GLN 89 N SERα53, GLYβ84A O SERα53, GLYβ84A, HIS β81 OE1 ASNα55, SERα53 NE2 ASPα55 OD2 SERα53, GLNα57, ASPα55 MET 90 N SER α53 O SERα53, SERβ85, GLUβ86 O HIS β81 NE2 SERβ55, SERα53, ASNβ82 SD SERα53, GLUα31, GLUβ86, THRα52, THRβ89 ARG91 N ASN β82 OD1 SERα53, SERβ85, VALβ78, THRβ77, GLUβ86 O ASN β82 ND2 GLYα9A, VALβ78, TYRα9, GLUβ86 NE THRβ77, GLUβ74 NH1 THR β77 O GLUβ74 NH2 THRβ77, GLUβ74 MET92 N TYRα9, ASNβ82, GLYα9A O GLUβ74, TYRα9. ASNα62 SD ASNα62, GLYα58 ALA93 N TYR α9 O ASnα62, GLUβ74, GLYα9A O ASNα11, ASNA62, GLY α58, GLUβ74, GLYα9A,TYRα9 THR94 N GLU β74 OE1 ASNα62, GLNβ70 O GLUβ74, TYRβ30, TYRβ47 OG1 GLU β70 NE2 GLUβ74 PRO95 N ASNα62, TYRβ30 O GLBβ70, ASNα62 LEU96 N ASNα69 O ASN α69 ND2 ILEα65, TYRβ9 LEU97 N ASNα69, TYRβ60, TYRβ67 O TYR β60 OH HISα68, TYRβ67, ASNα69, SERβ57 TYR98 N ASNα69 OD1 HISα68, ILEα65, SERβ57, TYRB60 O HIS α68 NE2 TYRβ60, ASNαa69 ARG99 N HISα68, ASNα69, SERβ57 O HISα68, PROβ56,SERβ57 NE PROβ56, ARGα76, GLUβ59, SERβ57 NH1 GLU β59 OE1 PROβ56, SERβ57 NH2 PRO β56 O, GLU β59 OE1 ARGα76, ARGβ55 PRO100 N ARGα76 O ARG α76 NE, ARG α76 NH2 ILEα72, PROβ56 OXT ARG α76 NH2 ARGα76, PROβ56 Tab. 20 Wechselwirkungen zwischen CLIPm88-100 und RT1.B l Im Vergleich zum RT1.B l – CLIP Komplex werden zahlreiche Wasserstoffbrücken - Bin- dungen zwischen CLIPm und RT1.B l mit an<strong>der</strong>en Aminosäuren eingegangen (Tab. 20). Vor allem das SER88 bildet weniger Wasserstoffbrücken – Bindungen aus als das
Ergebnisse Seite 130 SER88 des CLIP - Peptids. Auch das THR94 geht weniger solche Kontakte ein. Die Muta- tion an <strong>der</strong> Position 98, bei dem das Methionin gegen ein Tyrosin ausgetauscht ist, zeigt dieselben Wasserstoffbrücken. Bei den van <strong>der</strong> Waals – Kontakten sind ebenfalls etliche an<strong>der</strong>e Kontakte zu beobachten. Auch hier geht das SER88 weniger Kontakte mit dem RT1.B l Molekül ein als das SER88 des CLIP – Peptids. Das TYR98 bildet jedoch mehr Abb. 42 Intermolekulare Wechselwirkungen zwischen CLIPm und RT1.B van <strong>der</strong> Waals –KontakteausalsdasMET98desCLIP–Peptids. Wie die Abb. 42 zeigt, geht das SER88 weit weniger Wechselwirkungen mit RT1.B l ein. Sowohl CLIP als auch CLIPm gehen keine Wasserstoffbrücken – Bindungen mit MET92 und PRO95 ein. Die Aminosäure LEU97 des CLIPm – Peptids geht jedoch solche Bin-