Protein ? Disassembly im Verlauf der endosomalen Prozessierung
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Ergebnisse Seite 116<br />
Abb. 34 Solvent-Accessible-Area <strong>der</strong> Bindungsgrube<br />
Dargestellt ist die dem Lösungsmittel zugängliche Fläche in Stereo - Darstellung.<br />
Blick von oben auf die Bindungsgrube. α - Kette blau, β -Kette rot angefärbt.<br />
Anhand dieser Darstellung läßt sich für die erste Bindungstasche eine Präferenz für<br />
große, polare Aminosäuren wie Lysin, Arginin sowie für die sauren Aminosäuren able-<br />
sen. Ebenfalls könnte Glycin an <strong>der</strong> Position P1 binden. Nach <strong>der</strong> typischen Drehung<br />
des Peptides zeigen die Aminosäuren an den Positionen P2 und P3 aus <strong>der</strong> Bindungs-<br />
grube heraus. An <strong>der</strong> Stelle P4 binden bevorzugt unpolare Aminosäuren. Die Position P5<br />
zeigt wie<strong>der</strong> Richtung T - Zellrezeptor. An P6 ist eine Tasche für polare Aminosäuren. An
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