Angelika Semmler - KOPS - Universität Konstanz

Weitere Magazine

Empfehlungen

Info

8 Experimenteller Teil SRBS-pY241 SRBS-Leu-Lys-His-Asp-Thr-Asn-Ile-Tyr[PO(OH)2]-Cys-Arg-His-Asp-His-Lys-Ala-OH Präparative RP-HPLC (Eurosphere Säule): 30-45% B in 20 min, 9,8 ml/min) tR = 11,1 min ESI-MS: 2464,5 m/z [M+H] 1+ , 1233,3 m/z [M+2H] 2+ und 822,5 m/z [M+3H] 3+ Ausbeute: 13% (6,3 mg) Berechnet: C105H155N27O32PS4 + (exacte 2464,9946m/z, avarage 2466,7491 m/z) 152
8 Experimenteller Teil 8.3.10.3 Synthese des fluoreszenzmarkierten Peptids SRBS-Y230 Wie in AAV 2 beschrieben wurde das Wang-Harz mit Fmoc-Asp(O t Bu)-OH beladen (Beladungsdichte 0,7 mmol/g). Anschließend erfolgte nach AAV 7 die Elongation der ersten neun Aminosäuren am Synthesizer unter Verwendung des 20µM spezial.kem chemistry files. Im ersten Modul wurde das Harz gewaschen (Modulfolge: eGD). Die Modulfolge der darauffolgenden Zyklen lautete BbDAFiiiCid (Single Couple, Cap./5eq.). Mit einem abschließenden final wash (Modulfolge: Dc) wurde die vorläufige automatisierte SPPS beendet. Folgende Aminosäurebausteine wurden verwendet: Fmoc-Glu(O t Bu)-OH, Fmoc-His(Trt)-OH, Fmoc-Ile-OH, Fmoc-Leu-OH, Fmoc-Lys(Boc)-OH und Fmoc-Tyr( t Bu). Zur Überprüfung der Synthese wurden Testabspaltungen durchgeführt. Hierzu wurden kleine Mengen des Peptids entnommen und nach AAV 19 vorgegangen. Fmoc-Ile-Tyr-Glu-Glu-Leu-Leu-Lys-His-Asp-OH (119→) MALDI-TOF-MS: (roh) [M+H] + gemessen Intensität Beschreibung [M+H] + berechnet 1381,5 m/z 100% Fmoc-Ile…-OH 1381,6674 m/z (C68H93N12O19 + ) 1088,3 m/z 13% Ac-Tyr...-OH 1088,5259 m/z (C49H74N11O17 + ) 925,2 m/z 21% Ac-Glu 2 …-OH 925,4625 m/z (C40H65N10O15 + ) 796,2 m/z 9% Ac-Glu 1 ..-OH 796,4199 m/z (C35H58N9O12 + ) Der automatisierten SPPS folgte eine manuelle Abspaltung der N-terminalen Fmoc- Schutzgruppe nach AAV 10. Daraufhin wurde Fmoc-Ala-Ser(Ψ MeMe Pro)-OH (5 eq.) unter Aktivierung mit 5 eq. PyBOP, 5 eq. HOBt und 10 eq. DIPEA angeknüpft. Es wurde wie in AAV 3 beschrieben vorgegangen. Die weitere Verlängerung der Peptidkette erfolgte wiederum am Peptidsynthesizer. Hierzu wurde wie bereits zu Beginn der Synthese beschrieben vorgegangen. Folgende Aminosäurebausteine kamen zum Einsatz: Fmoc-Ala-OH, Fmoc-Arg(Pbf)- OH, Fmoc-Pro-OH und Fmoc-Thr( t Bu)-OH. Zur Überprüfung der Synthese wurden Testabspaltungen durchgeführt. Hierzu wurden kleine Mengen des Peptids entnommen und nach AAV 19 vorgegangen. 153
Seite 1 und 2:
Neue Methoden zur Sequenzierung fes
Seite 3:
meinem Großvater Albert Anton Höf
Seite 6 und 7:
Vorwort Natürlich gibt es ein Lebe
Seite 8 und 9:
Inhaltsverzeichnis 4 ANALYTIK 47 4.
Seite 10 und 11:
Inhaltsverzeichnis 8.6 SPR-Experime
Seite 12 und 13:
Abkürzungen DMF N,N’-Dimethylfor
Seite 14 und 15:
Abkürzungen TG Tenta Gel Thi Thien
Seite 16 und 17:
1 Einleitung Echinocandin 2 (Abb. 1
Seite 18 und 19:
1 Einleitung 1.2 Cyclopeptidbibliot
Seite 20 und 21:
1 Einleitung 1.3 Die Problematik de
Seite 22 und 23:
1 Einleitung Eine weitere Möglichk
Seite 24 und 25:
1 Einleitung 1.4 Fluoreszenzmarkier
Seite 27 und 28:
2 Aufgabenstellung 2.1 Analytik von
Seite 29 und 30:
3 Sollbruchstellen 3 Sollbruchstell
Seite 31 und 32:
3 Sollbruchstellen Abb. 3.3 Der Fmo
Seite 33 und 34:
3 Sollbruchstellen Die erhaltenen C
Seite 35 und 36:
3 Sollbruchstellen Abb. 3.8 Ausschn
Seite 37 und 38:
3 Sollbruchstellen Bestrahlung für
Seite 39 und 40:
3 Sollbruchstellen HSQC-, TOCSY- un
Seite 41 und 42:
3 Sollbruchstellen Neben der Bromcy
Seite 43 und 44:
3 Sollbruchstellen Die Synthese des
Seite 45 und 46:
3.2.1.1 Der Arylhydrazin-Linker 3 S
Seite 47 und 48:
3 Sollbruchstellen Aminosäureester
Seite 49 und 50:
3 Sollbruchstellen Beide Linker wur
Seite 51 und 52:
3 Sollbruchstellen Zur Erstellung d
Seite 53 und 54:
3 Sollbruchstellen 39
Seite 55 und 56:
3 Sollbruchstellen Die Literaturaus
Seite 57 und 58:
3 Sollbruchstellen Zur anschließen
Seite 59 und 60:
3 Sollbruchstellen erfolgte die Cyc
Seite 61 und 62:
4 Analytik 4 Analytik Wie bereits i
Seite 63 und 64:
4 Analytik Fragmentionen der Seiten
Seite 65 und 66:
4 Analytik Abb. 4.4 MS(2) Spektrum
Seite 67 und 68:
4 Analytik Tabelle 4 Peakliste der
Seite 69 und 70:
4 Analytik Abb. 4.6 Summe aller MS(
Seite 71 und 72:
N C S Phenylisothiocyanat Kupplung
Seite 73 und 74:
4 Analytik machen [91-94] . Mit dem
Seite 75 und 76:
4.2.3.1 Anwendung des Konzepts auf
Seite 77 und 78:
4 Analytik Abb. 4.11 MALDI-TOF Mass
Seite 79 und 80:
4 Analytik präparativer RP-HPLC au
Seite 81 und 82:
4.2.3.3 Anwendung des Konzepts auf
Seite 83 und 84:
4 Analytik Der Vergleich verschiede
Seite 85 und 86:
5 Anwendung der Methode 5 Anwendung
Seite 87 und 88:
5 Anwendung der Methode Bindungstas
Seite 89 und 90:
5.2 Aufbau einer OBOC-Cyclopeptidbi
Seite 91 und 92:
5.3 Das Screening 5 Anwendung der M
Seite 93 und 94:
5 Anwendung der Methode Tabelle 6
Seite 95 und 96:
5 Anwendung der Methode (pH 7-9.2)
Seite 97 und 98:
5.4 Die Hitbead-Peptidsequenzen 5 A
Seite 99 und 100:
Xaa2 Position Xaa3 Xaa4 Xaa5 Xaa6 A
Seite 101 und 102:
5.5.1 Synthese der ausgesuchten Pep
Seite 103 und 104:
5 Anwendung der Methode Oberfläche
Seite 105 und 106:
5 Anwendung der Methode Die Immobil
Seite 107:
Verbindungsnr. Linear/Cyclisch 5 An
Seite 110 und 111:
6 Synthese fluoreszenzmarkierter Ph
Seite 112 und 113:
Seite 114 und 115:
Seite 116 und 117: 6 Synthese fluoreszenzmarkierter Ph
Seite 124 und 125: 7 Zusammenfassung und Ausblick sich
Seite 126 und 127: 7 Zusammenfassung und Ausblick Konz
Seite 128 und 129: 7 Zusammenfassung und Ausblick Bind
Seite 130 und 131: 7 Zusammenfassung und Ausblick Auch
Seite 132 und 133: 8 Experimenteller Teil 1046,54 m/z,
Seite 134 und 135: 8 Experimenteller Teil 8.2 Allgemei
Seite 136 und 137: 8 Experimenteller Teil AAV 6 Bestim
Seite 138 und 139: 8 Experimenteller Teil geladen. Das
Seite 140 und 141: 8 Experimenteller Teil sowie eine 0
Seite 142 und 143: 8 Experimenteller Teil AAV 16 Basis
Seite 144 und 145: 8 Experimenteller Teil für eine St
Seite 146 und 147: 8 Experimenteller Teil Cyclo[Pll-Gl
Seite 148 und 149: 8 Experimenteller Teil 8.3.2 Synthe
Seite 158 und 159: 8 Experimenteller Teil 8.3.8.1 Tryp
Seite 160 und 161: 8 Experimenteller Teil 8.3.8.4 Synt
Seite 162 und 163: 8 Experimenteller Teil HPQ-Motiv, a
Seite 164 und 165: 8 Experimenteller Teil 8.3.10 Synth
Seite 168 und 169: 8 Experimenteller Teil Fmoc-Pro-Arg
Seite 170 und 171: 8 Experimenteller Teil 8.4 Modell i
Seite 172 und 173: 8 Experimenteller Teil 8.5 On-bead-
Seite 174 und 175: 8 Experimenteller Teil 8.5.3 Enzymg
Seite 176 und 177: 8 Experimenteller Teil 8.6 SPR-Expe
Seite 179 und 180: 9 Literaturverzeichnis 9 Literaturv
Seite 181 und 182: 9 Literaturverzeichnis [64] P. D. W
Seite 183 und 184: 9 Literaturverzeichnis [133] T. Woh
Seite 185 und 186: 10 Anhang 10.1 HPLC-offline-MS-Char
Seite 187 und 188: 10.1.3 Peptid 71 (enzymatische Ring
Seite 189 und 190: 10.1.5 SPR Peptide 92-97 H-Lys-His-
Seite 191 und 192: H-Lys-Gln-Pro-His-His-Gly-Glu-βAla
Seite 193 und 194: H-Lys-His-Pro-Gln-His-Gly-Glu-βAla
Seite 195 und 196: 10.2 Massenspektren der fluoreszenz
Seite 197 und 198: 10.3 MALDI-TOF-Massenspektren nach
Seite 199 und 200: Intens. 800 600 400 200 Intens. 200
Seite 201 und 202: Intens. x104 1.0 0.8 0.6 0.4 0.2 0.
Seite 203 und 204: Intens. 1000 800 600 400 200 Intens
Seite 205 und 206: Intens. 1000 800 600 400 200 0 Inte
Seite 207 und 208: Intens. 6000 4000 2000 0 Intens. 30
Seite 209 und 210: 10.4 PTH-Val 10.4.1 1 H-NMR-Spektre
Seite 211 und 212: 10 Anhang 197
Seite 213 und 214: Peptid 10 tR = 9,7 min Peptid 10 tR
Seite 215 und 216: Peptid 10 tR = 9,7 min Peptid 10 tR
Seite 217 und 218:
10.6 SPR-Experimente Steady state a
Alle anzeigen

Angelika Semmler - KOPS - Universität Konstanz

Sie wollen auch ein ePaper? Erhöhen Sie die Reichweite Ihrer Titel.

Template löschen?

Als Template speichern?