Angelika Semmler - KOPS - Universität Konstanz

4 Analytik
4 Analytik
Wie bereits in der Einleitung erwähnt, müssen cyclische Peptide vor ihrer
Sequenzanalyse in lineare Peptide überführt werden. Im vorhergehenden Kapitel
wurden verschiedene Wege aufgezeigt und diskutiert, um eine solche Umwandlung
zu realisieren. Das nun folgende Kapitel beschäftigt sich mit der Frage: Welche
Aminosäurensequenz hat das cyclische, beziehungsweise vormals cyclische, Peptid,
das auf dem Hitbead gebunden war?
4.1 De-novo-Sequenzierung
Die De-novo-Sequenzierung von Peptiden ist ein Verfahren zur Bestimmung der
Aminosäuresequenz (Primärstruktur). Im Gegensatz zum in der Proteomic weit
verbreiteten Peptid-Mapping stehen diesem Verfahren keinerlei Vorkenntnisse
hinsichtlich der DNA- oder Proteinsequenz zur Verfügung. Das heißt, die
Aminosäurensequenz muss nicht „nur“ bestätigt werden, sondern von Neuem (lat.
De novo) -im Sinne von „von Grund auf“- gefunden werden. Diese Sequenz-
verifizierung wird mittels Massenspektrometrie durchgeführt. [76]
Abb. 4.1 Komponenten eines Massenspektrometers.
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