Angelika Semmler - KOPS - Universität Konstanz

Inhaltsverzeichnis
7 ZUSAMMENFASSUNG UND AUSBLICK 109
7.1 Analytik von Cyclopeptiden 109
7.2 Fluoreszenzmarkierte Phosphopeptide 114
8 EXPERIMENTELLER TEIL 117
8.1 Allgemeine Angaben zur Analytik 117
8.1.1 HPLC 117
8.1.2 Massenspektrometrie 117
8.1.3 Kernresonanzspektroskopie 118
8.1.4 Infrarotspektroskopie 119
8.1.5 UV-Vis-Absorptionsspektroskopie 119
8.2 Allgemeine Arbeitsvorschriften für die SPPS 120
8.3 Synthetisierte Peptide 131
8.3.1 Synthese der photolabilen cyclischen Peptide 8-12 131
8.3.2 Synthese des cyclischen Peptids 31 zur Untersuchung von Methionin als Sollbruchstelle 134
8.3.3 Synthese des cyclischen Peptids 41 zur Untersuchung von Methionin als Sollbruchstelle 136
8.3.4 Synthese des Peptids 51/52 zur Stabilitätsuntersuchung des Glykolamid-Linkers und des HMBA-
Linkers 138
8.3.5 Synthese des festphasengebundenen Peptids 63 zur Untersuchung der Trp-Xaa Sollbruchstelle 140
8.3.6 Synthese des festphasengebundenen Peptids 66 zur Untersuchung von Trp als Linker 141
8.3.7 Synthese des festphasengebundenen Peptids 77 als Modellpeptid zur Etablierung des Partiellen
Edman-Abbaus (PED) 142
8.3.8 Synthese des Peptids 71 zur Untersuchung einer enzymatischen Ringöffnung 143
8.3.9 Synthese der Peptide (92-97) zur Bestimmung der KD-Werte 147
8.3.10 Synthese der fluoreszenzmarkierten Peptide 150
8.4 Modell in Lösung zur Aufklärung der Nebenreaktion im PED 156
8.4.1 Synthese von 5-Isopropyl-3-phenyl-2-thiohydantoin (PTH-Val) 81 156
8.4.2 Synthese von 5-Isopropyl-3-phenyl-2-hydantoin 82 157
8.5 On-bead-Screening 158
8.5.1 Zusammensetzung der Puffer und Lösungen für das Screening: 158
8.5.2 Biotinyliertes TentaGel S-NH2 159
8.5.3 Enzymgekoppelter Farbreaktionstest 160
8.5.4 Partielle Edman-Sequenzierung 161
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