Angelika Semmler - KOPS - Universität Konstanz

5 Anwendung der Methode
und Affinität. Bei gleicher Peptidsequenz bindet das lineare Peptid 1000fach
schlechter als die durch Cyclisierung strukturell eingeschränkten Gegenspieler.
Peptidsequenz
Tabelle 5 Literaturwerte von Streptavidin-„HPQ-Peptid“-Bindungskonstanten. *:für
Werte, die mittels SPR bestimmt wurden, wird zwischen steady-state-affinity
(ssa) und kinetischer (kin) Auswertung unterschieden. ND: aufgrund zu
geringer Affinität konnten keine Bindungskonstanten bestimmt werden.
K D (µM)
*ssa./kin.
Methode Lit
AECHPQGPPCIEGRK --/0,23 SPR (Pept. Immob.) [118]
AESHPQGPPSIEGRK ND SPR (Pept. Immob.) [118]
AEC(Acm)HPQRPPC(Acm)IEGRK ND SPR (Pept. Immob.) [118]
AECHPQFSNCIEGRK ND SPR (Pept. Immob.) [118]
AECHPQFPCIEGRK ND SPR (Pept. Immob.) [118]
AECHPQFSNCIEGRK ND SPR (Pept. Immob.) [118]
AECHPQFNCIEGRK ND SPR (Pept. Immob.) [118]
AECHPQFCIEGRK --/0,66 SPR (Pept. Immob.) [118]
FSHPQNT 125,0 ITC [117]
HDHPQNL 282,0 ITC [117]
Ac-AHPQFPAEK-CONH 2 357,0/ -- SPR (SA Immob.) [119]
Cyclo[AHPQFPAE]K-NH 2 0,270/0,257 SPR (SA Immob.) [119]
Cyclo[AHPQFPAE(K-NH 2)] 0,435/0,355 SPR (SA Immob.) [119]
H 2 N-AWRHPQFGG-OH (pStrep tag) 36,79 ITC [115]
F V -Strep-Tag (exprim.Protein+tag) 18,38 ITC [115]
Ac-WSHPQFEK-OH (pStrepTagII) 72,0 ITC
H2N-CWHPQAGC-OH 13,0 ITC
Es bleibt aber zu erwähnen, dass in der Literatur auch mehrfach Hitsequenzen
gefunden wurden, deren Bindung zu Streptavidin so schwach war, dass die
dazugehörigen KD-Werte nicht bestimmt werden konnten. [90, 118] Meist wurden
ersatzweise IC50-Werte bestimmt.
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