Angelika Semmler - KOPS - Universität Konstanz

N C S
Phenylisothiocyanat
Kupplung
Spaltung
Konvertierung
N
H
S
N
H
R 1
+
H
N
O R 2
H
N
H S O
2-Anilinothiazolin-5-on
N
H
S
N
R 1
H 2O/H
N
H
OH
R 1
O
H 2N
O
OH
+
R 1
N
H
H
N
O R 2
R 3
Peptid
O
H 3N
O
N
H
R 3
O
Phenylthiocarbamat-Addukt
(PTC-Peptid)
R 2
H 2O
Phenylthiocarbamoylsäure 3-Phenyl-2-thiohydantoin
(PTH-Aminosäure)
Abb. 4.7 Reaktionskaskade des Edman-Abbaus.
O
N
H
R 3
O
O
N
S
N
R 1
H
4 Analytik
Peptid mit freiem
N-Terminus,
neue Runde im
Abbauzyklus
Die Mikrosequenzierung ist eine durchaus häufig in der Literatur anzutreffende
Methode zur Sequenzanalyse von Hitbeads, die aus einem Screening einer OBOC-
Peptidbibliothek hervorgingen. [88] Auch in unserer Arbeitsgruppe wurden Hit-
[73, 74]
sequenzen aus OBOC-Peptidbibliotheken mittels Edman-Abbau charakterisiert.
Ein großer Nachteil dieser Methode ist jedoch der relativ hohe Zeitaufwand. Mit einer
Sequenzierungsrate von bestenfalls 3-4 Hitkugeln pro Tag ist die Methode nur
bedingt für einen Einsatz im Hochdurchsatzverfahren geeignet. Die Erfahrungen
unserer Gruppe zeigten sogar, dass man mit nur einer Kugel pro Tag rechnen sollte.
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