Abstract 230 - IMPIEGO DEI GLICOPEPTIDI NELLA ... - SIMIT

Abstract 182
- PREVALENZA DEI SOTTOTIPI DI HIV-1 NON B IN SARDEGNA -
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10° CONGRESSO NAZIONALE SIMIT
Madeddu G.* [1] , Ciccozzi M. [2] , Lo Presti A. [2] , Cella E. [2] , Coinu G. [1] , Budroni C. [1] , Soddu A. [1] , Rezza G. [2] ,
Mura M. S. [1]
- [1] Istituto di Malattie Infettive, Università di Sassari ~ Sassari - [2] Dipartimento di Malattie Infettive, Istituto Superiore di
Sanità ~ Roma
INFEZIONI DA HIV
Premessa: La prevalenza di sottotipi di HIV-1 non B varia dal 12,2% al 12,6% in studi
condotti in Toscana e Puglia e in Lombardia. La prevalenza di sottotipi di HIV-1 non B in
Sardegna non è nota.
Obiettivo: Abbiamo condotto uno studio sulle sequenze del gene della proteasi di HIV in
una popolazione di pazienti con infezione da HIV residenti in Sardegna con l‟obiettivo di
valutare la prevalenza dei sottotipi non B.
Risultati: Le sequenze del gene Pol di HIV-1 di 242 pazienti sono state allineate e
comparate con tutte le sequenze di riferimento di HIV-1 disponibili nel data base della
gene bank di Los Alamos. Il software per l‟allineamento utilizzato è stato CLUSTAL X.
Dopo l‟allineamento è stato necessario un editing manuale delle sequenze per ristabilire il
frame di lettura del gene e rimuovere tutti i gaps aperti dall‟algoritmo utilizzato. L‟albero
filogenetico è stato costruito utilizzando il programma PAUP. Il modello evolutivo di
maximum likelihood utilizzato era HKY scelto per mezzo del programma Model Test.
Abbiamo analizzato le sequenze provenienti da 242 pazienti. Il 91,3% (n=221) erano
portatori di HIV-1 B mentre sottotipi non-B sono stati riscontrati in 21 pazienti (8,7%). Tra i
sottotipi non B, 6 erano classificati come A1 (28,6%), 5 come F1 (23,8%), 2 come C
(9,5%), 2 come G (9,5%) e 1 come D (4,8%). Cinque (23,8%) pazienti, inoltre, erano
classificati come forme ricombinanti. Tra i pazienti con sottotipi non B, 16/21 (76,2%)
erano stranieri provenienti principalmente dall‟Africa Sub-Sahariana e dall‟Est Europa
mentre 5 (23,8%) erano italiani.
Conclusione: I nostri risultati dimostrano come anche in Sardegna circolino sottotipi di
HIV-1 non B anche se con prevalenze inferiori rispetto ad altre regioni italiane. I sottotipi
non B sono stati riscontrati principalmente in stranieri provenienti da zone di elevata
endemia per infezione da HIV-1 con prevalenza di sottotipi non B ma anche nella
popolazione italiana.