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Una vez resuelto un conflicto, atendía otro, como que, ante la falta de postulantes
para el sacerdocio, logró en el Seminario Tridentino aumentar las becas, de
ciento una a trescientas, así como las rentas del mismo, o sea, de 17 583 pesos a 45
000 anuales. Instituyó además un sistema de estímulos a los seminaristas, exigió cátedras
y mejoró las existentes, e impulsó la creación del Seminario de Instrucción en
Tepozotlán para la preparación, el retiro y la corrección del clero. Mandó reedificar
casi por completo el Colegio de Instrucción de Niñas de San Miguel de Belem (en
las calles de Balderas y Chapultepec) bajo una erogación de 100 000 pesos. Además
estableció diversas clases de oficios para las colegialas y dotes para las que tomaran
estado, es decir, el hábito conventual. Contribuyó eficazmente al desarrollo y perfeccionamiento
de la Casa de Niños Expósitos, para lo cual señaló con precisión,
en sus ordenanzas, horarios de clases, materias que debían enseñarse, etc., y, como
complemento, una junta de atención laboral posescolar de alumnos egresados de
dicha institución.
En el aspecto científico, nombró a especialistas para que estudiaran y observaran
el paso de un cometa que había sido visto en 1532 y 1661, y que, según se calculaba,
pasaría en 1788. Además facilitó toda la ayuda requerida por la comisión encargada
por Carlos III para explorar científicamente la región septentrional del virreinato,
que estaba presidida por Martín de Sessé y Lacaste, y a la cual se incorporó el científico
mexicano y catedrático de botánica, matemáticas y filosofía, José Mariano Mociño.
Aunado a lo anterior, apoyó la propuesta de Sessé para el establecimiento de un
jardín botánico en la capital, cuyos planos estuvieron a cargo del ingeniero militar
Miguel Constanzó. Debe señalarse que en 1788 la exploración de Sessé y Mociño
para la recolección de especies se extendió a un territorio de más de 3000 leguas cuadradas,
que abarcaban desde California hasta Costa Rica, con lo que se logró formar
un herbario de más de cuatro mil especies y una colección de dibujos incluidos en
dos obras: “Flora Mexicana y Plantae Movae Hispanie”, que desgraciadamente no
llegaron a publicarse.