francine blumental de abreu - PHL © Elysio - FUNDAÇÃO ANTÔNIO ...

More documents

Recommendations

Info

ganho variaram entre 18,0 Kb a 1,5 Mb (18.039 a 1.513.410 pb), envolvendo 23 genes e um microRNA, enquanto as perdas variaram de 24,5 Kb a 3,4 Mb (24.499 a 3.744.294 pb), englobando 180 genes e quatro microRNAs. 119 O tamanho das CNVs, envolvidas tanto em ganhos como em perdas, identificadas nos pacientes com mutação no gene MLH1 foi maior quando comparado com os pacientes com mutação nos genes BRCA1 e BRCA2. Porém essa diferença não foi significativa (P= 0,6982 e P= 0,8327, respectivamente; Teste de Mann-Whitney). Entre os microRNAs identificados nos pacientes com mutação, apenas o hsa-mir-1268, envolvido em ganho genômico e mapeado em 15q11.2, foi detectado em mais de um paciente SM86 (BRCA2) e SM41 (MLH1). Porém essa alteração não foi idêntica e foi também identificada em pacientes não portadores de mutações (Tabela 19). Após a comparação com o grupo de referência (100 mulheres brasileiras saudáveis) e com o banco de dados DGV, as pacientes portadoras de mutações em BRCA1/BRCA2 apresentaram oito CNVs raras (quatro ganhos e quatro perdas genômicas) e uma nova rara (ganho genômico). As pacientes portadoras de mutação em MLH1 apresentaram 11 CNVs raras (seis ganhos e cinco perdas genômicas) e duas novas raras (um ganho e uma perda genômica). Na Tabela 18 estão representadas todas as CNVs identificadas nos pacientes SM50, SM89, SM102, SM86, SM41 e SL36.
Tabela 18 - Alterações identificadas nos pacientes com mutação nos genes BRCA1, BRCA2 e MLH1. BRCA1 Casos SM89 (G1) SM50 (G2) SM102 (G2) BRCA2 Casos SM86 (G1) Região Cromossômica Start End Tamanho (pb) Grupo Controle Tipo CNV Nº Sondas Evento P valor Genes MicroRNAs 3q26.1 163997028 164101976 104948 >1% Comuns 6 P 6,64E-72 -* - ++ 4q13.2 69074940 69145174 70234 >1% Comuns 6 P 6,73E-42 UGT2B17 - ++ 6q14.1 79035691 79080188 44497 >1% Comuns 3 P 3,40E-47 -* - ++ Xp22.2 11023614 11140914 117300 0 Nova rara 10 G 3,21E-34 HCCS, ARHGAP6 - - Xp22.2 15489239 15693445 204206 0 Rara 19 G 1,76E-49 ACE2, TMEM27, CA5BP, CA5B - + 6p11.2 57354689 57598026 243337 0 Rara 21 G 4,36E-11 PRIM2 - ++ 7q34 142535765 142616483 80718 0 Rara 7 P 1,33E-14 PIP, TAS2R39 - + 9p21.1 31161777 31589210 427433 0 Rara 19 P 2,12E-30 -* + 6p21.33 29962649 29982112 19463 1% Rara 3 p 6,28E-21 HLA-H, HCG2P7 - ++ Região Cromossômica Start End Tamanho (pb) Grupo Controle Tipo Nº Sondas Evento P valor Genes MicroRNAs 1p31.1 72541243 72568209 26966 >1% Comuns 3 G 3,04E-14 -* - ++ 14q11.1 - q11.2 18798441 19467712 669271 0 Rara 12 G 8,01E-18 15q11.2 19536835 20060261 523426 1% Rara 23 G 2,48E-45 22q11.23 22701005 22720395 19390 0 Rara 3 P 3,64E-15 P704P, OR4Q3, OR4M1, OR4N2, OR4K2, OR4K5 LOC727924, OR4M2, OR4N4, LOC650137 LOC391322, GSTT1, GSTTP2 120 Nº CNVs Nº CNVs - ++ hsa-mir-1268 ++ - ++
Page 1 and 2:
VARIAÇÃO NO NÚMERO DE CÓPIAS GE
Page 3 and 4:
A minha família!!!! DEDICATÓRIA
Page 5 and 6:
À minha orientadora... Dra Silvia
Page 7 and 8:
As Instituições de Fomento... FAP
Page 9 and 10:
Entre os pacientes sem mutação, f
Page 11 and 12:
(exclusive from group 1) and FOXP1
Page 13 and 14:
Figura 11 Representação esquemát
Page 15 and 16:
LISTA DE TABELAS Tabela 1 Classific
Page 17 and 18:
Tabela 25 Alterações identificada
Page 19 and 20:
LISTA DE SIGLAS E ABREVIATURAS aCGH
Page 21 and 22:
UTR* Untranslated region VNTR* Vari
Page 23 and 24:
4.2.3 Análise de CNVs entre os fam
Page 25 and 26:
O câncer colorretal (CCR) é o ter
Page 27 and 28:
vezes, está associado com a histó
Page 29 and 30:
análise de MSI é realizada pela P
Page 31 and 32:
(2010) relataram que o tumor extrac
Page 33 and 34:
1.2 SÍNDROME DE CÂNCER DE MAMA-C
Page 35 and 36:
PMS2). Segundo os autores, é mais
Page 37 and 38:
contribuir para a patogênese e pro
Page 39 and 40:
contém um elemento upstream que re
Page 41 and 42:
2 OBJETIVOS 2.1 OBJETIVO PRINCIPAL
Page 43 and 44:
Figura 1 - Fluxograma representando
Page 45 and 46:
o SMCMH2: pelo menos um indivíduo
Page 47 and 48:
Tabela 1 - Dados clínicos e histop
Page 49 and 50:
Page 51 and 52:
Page 53 and 54:
(1100delC) e TP53. Neste estudo, fo
Page 55 and 56:
Tabela 5 - Iniciadores utilizados n
Page 57 and 58:
Tabela 6 - Condições da PCR para
Page 59 and 60:
As sequências alteradas foram clas
Page 61 and 62:
por 2 horas e 65°C por 15 min. Foi
Page 63 and 64:
As regiões identificadas como alte
Page 65 and 66:
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov, http:
Page 67 and 68:
Figura 2 - Representação gráfica
Page 69 and 70:
O gene de referência, GAPDH, é fr
Page 71 and 72:
(tissue microarray - TMA), contendo
Page 73 and 74:
citoplasmática moderada, porém em
Page 75 and 76:
4 RESULTADOS 4.1 SEQUENCIAMENTO 4.1
Page 77 and 78:
Tabela 10 - Mutações não patogê
Page 79 and 80:
Figura 5 - Representação gráfica
Page 81 and 82:
número maior de CNVs, quando compa
Page 83 and 84:
21 não apresentaram CNVs. Por outr
Page 85 and 86:
A. C. Figura 7 - Representação gr
Page 87 and 88:
envolvida em perda genômica, prese
Page 89 and 90:
Cont/ Tabela 11 Região Cromossômi
Page 91 and 92: Cont/ Tabela 11 Região Cromossômi
Page 101 and 102: As CNVs raras e novas raras foram c
Page 107 and 108: Cont/ Tabela 13 CNVs Raras Exclusiv
Page 115 and 116: Cont/ Tabela 14 CNVs Novas Raras Ex
Page 117 and 118: Tabela 15 - Alterações com genes
Page 119 and 120: Tabela 16 - Funções dos genes map
Page 121 and 122: Entre as CNVs novas raras comuns ao
Page 123 and 124: 100
Page 125 and 126: 102 Entre as CNVs novas raras exclu
Page 127 and 128: 14q32.11: gene FOXN3 End: 89.136.41
Page 129 and 130: 7p22.2: gene MAD1L1 Start: 2.106.88
Page 131 and 132: 108 Entre as CNVs novas raras exclu
Page 133 and 134: Start: 71.124.097 3p14.1: gene FOXP
Page 135 and 136: Start: 71.478.161 17q25.1: genes AC
Page 137 and 138: 7q36.3: gene PTPRN2E2 Start: 158.00
Page 139 and 140: Start: 49.039.910 13q14.3: gene RCB
Page 141: mutações no gene de reparo MLH1 (
Page 145 and 146: Cont/ Tabela 18 Casos SL36 (G2) Reg
Page 147 and 148: 124 Na Tabela 20 estão representad
Page 149 and 150: família foi identificada apenas um
Page 151 and 152: Tabela 21 - Alterações identifica
Page 157 and 158: Cont/ Tabela 23 Casos Região Cromo
Page 161 and 162: Cont/ Tabela 26 Casos Região Cromo
Page 163 and 164: Figura 17 - Heredograma do caso SM5
Page 165 and 166: 142 A plataforma de 4x180K (Agilent
Page 167 and 168: Start: 78.990.568 3p12.3: gene ROBO
Page 169 and 170: 146 Após a identificação, por CG
Page 171 and 172: Figura 21 - Representação gráfic
Page 173 and 174: Tabela 29 - Cálculo do intervalo d
Page 175 and 176: Figura 23 - Análise gráfica dos r
Page 177 and 178: epresenta uma comparação em barra
Page 179 and 180: 156 Após a caracterização da ext
Page 181 and 182: ROBO1. Em 61,12% das amostras foi d
Page 183 and 184: 160 Tabela 33 - Associação entre
Page 185 and 186: 162 Não houve associação signifi
Page 187 and 188: 164 Tabela 34 - Associação entre
Page 189 and 190: 4.3.2 Família SM89 166 Após a con
Page 191 and 192: 168 No exame clínico, a probanda e
Page 193 and 194:
170 A SM89.2 (III:3), negativa para
Page 195 and 196:
172 A SM89.5 (IV:5), positiva para
Page 197 and 198:
174 A presença de pequenos cromoss
Page 199 and 200:
176 BRCA1 apresentaram 12 CNVs (SM8
Page 201 and 202:
Tabela 37 - Alterações identifica
Page 203 and 204:
Cont/ Tabela 37 Casos Região Cromo
Page 205 and 206:
5 DISCUSSÃO 182 As variações gen
Page 207 and 208:
câncer de mama e cólon. Grande pa
Page 209 and 210:
para mutação nos genes de predisp
Page 211 and 212:
N (SLC38A3 e SLC38A5), porém todos
Page 213 and 214:
alterações, GRM1, MAD1L1 e NPAS1
Page 215 and 216:
192 Neste estudo, o ganho genômico
Page 217 and 218:
sugeriram que a nova variante do ge
Page 219 and 220:
como linfomas, além de uma associa
Page 221 and 222:
taxas de crescimento celular quando
Page 223 and 224:
200 Segundo dados da literatura, os
Page 225 and 226:
de CNVs também foi observado nas p
Page 227 and 228:
5.1.3 Análise de CNVs entre os fam
Page 229 and 230:
colorretal, quatro em linhagem celu
Page 231 and 232:
produzidos durante o catabolismo do
Page 233 and 234:
envolvendo essa região cromossômi
Page 235 and 236:
tem sua eficiência 10 vezes reduzi
Page 237 and 238:
214 As GTPases são responsáveis p
Page 239 and 240:
carcinomas primários de cabeça e
Page 241 and 242:
com história familial avaliadas no
Page 243 and 244:
também demonstraram que pacientes
Page 245 and 246:
cromossômicas foram observadas tan
Page 247 and 248:
A paciente SM87 (grupo 2) apresento
Page 249 and 250:
226 Banyard J, Barrows C, Zetter BR
Page 251 and 252:
228 Chung GT, Sundaresan V, Hasleto
Page 253 and 254:
230 Fre S, Huyghe M, Mourikis P, Ro
Page 255 and 256:
232 Höglund PJ, Nordström KJ, Sch
Page 257 and 258:
234 Kuiper RP, Ligtenberg MJ, Hooge
Page 259 and 260:
236 Mills RE, Walter K, Stewart C,
Page 261 and 262:
238 Peltomäki P, Vasen HF. Mutatio
Page 263 and 264:
240 Selamat SA, Galler JS, Joshi AD
Page 265 and 266:
242 Thélu J, Rossio P, Favier B. N
Page 267 and 268:
244 Wang J, Luo MH, Zhang ZX, et al
Page 269:
Anexo 1 - Heredogramas
Page 324:
Anexo 3 - Critérios de Bethesda pa
show all

francine blumental de abreu - PHL © Elysio - FUNDAÇÃO ANTÔNIO ...

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?