Сборник 69 конференции ВолгГМУ 27-30 апреля 2011

69-я открытая научно-практическая конференция молодых ученых и студентов с международным участиемУДК 616.91.93К. В. Жуков, С. С. Савченко, В. А. АнтоновМОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ВИРУСА ЛИХОРАДКИ ЗАПАДНОГОНИЛА, ЦИРКУЛИРУЮЩЕГО НА ТЕРРИТОРИИ ЮЖНОГО ФЕДЕРАЛЬНОГО ОКРУГА РФФедеральное государственное учреждение здравоохранения «Волгоградский научноисследовательскийпротивочумный институт» Федеральной службы по надзору в сфере защитыправ потребителей и благополучия человекаФедеральное агентство по здравоохранению и социальному развитию,Волгоградский государственный медицинский университетИсследование поддержано грантом РГНФ № 11-16-34011 a/BВведение. За последние 20 лет заболеваемостьлихорадкой Западного Нила отмеченав большинстве стран СНГ. На территории Россиивыделение вируса от больных впервые осуществленов Астрахани в 1967 г. В 1999 г. в Волгоградскойобласти была зарегистрирована перваявспышка лихорадки Западного Нила, во времякоторой заболело 380 человек, из которых 38 (10%) - погибло. Впоследствии на территории ЮФО,и в том числе в Волгоградской области, неоднократнорегистрировались крупные вспышки этойинфекции, последняя из которых возникла в периодс июля по сентябрь 2010 года, и было инфицированоболее 470 человек.Цель исследования. Провести сравнительныйанализ геномов вируса ЛЗН и определитьгенетические особенности его штаммов,выделенных во время вспышек заболевания натерритории ЮФО.Результаты собственных исследованийи выводы. При сравнительном молекулярно-генетическоманализе 390 секвенированныхполногеномных последовательностей РНКвируса ЛЗН, представленных на интернет ресурсеNCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/), выявленачрезвычайно высокая генетическая гетерогенность,преимущественно выражающаяся в наличиимногочисленных однонуклеотидных замен навсей протяженности генома. При одновременномсравнении разных генотипов вируса ЗН коэффициентгенетического подобия в составе нуклеотидныхпоследовательностей составил всего54,8 % на всей протяженности их генома. Крометого обнаружена вариабельная область, расположеннаяна участке неструктурного гена NS5 ипоследовательности 3’UTR, локализованных с10370 до 10600 п.н., содержащая обширныефрагменты делеций и нуклеотидных замен. Наибольшаягомология наблюдалась в неструктурныхэлементах и составляла 51,4 % - 57,7 %,структурные элементы формировали гомологиюна уровне 40,7 %-52,5 %, за исключением гена Сбелка, уровень гомологии которого составил 64,1%. На основе проведенного кластерного анализасформировано 6 генетических групп. При исследованииштаммов внутри каждой группы, гетерогенностьвирусной РНК значительно снижается.В частности, для группы штаммов линий 1 и 2гомология нуклеотидных последовательностейсоставляла 96,5 % и 95,0 %, соответственно. Генотипическаяпринадлежность вируса ЛЗН натерритории ЮФО неоднородна (рис.1).Рисунок 1. Дендрограмма кластерного анализа генетического разнообразия штаммоввируса ЛЗН на территории ЮФО.ГЕНОТИП IIГЕНОТИП IРанее в этом регионе доминировал I генотип.В 2004 г. в Ростовской области впервыезарегистрирован II генотип. До 1999 года II генотипвстречался лишь на территории Южной Африки.В Волгоградской области выявлены единичныеизоляты и IV генотипа. Секвенированиемгеномов вируса ЗН подтверждены данные о том,что вспышки заболевания 2007 года и 2010 годана территории Волгоградской области также вызваныгенотипом II. Полученные данные свидетельствуюто тенденции к расширению эндемичныхтерриторий этого генотипа ВЗНЭтот факт обуславливает трудности конструированиятест-систем для генной диагностикивируса ЛЗН, обусловленные необходимостьюподбора РНК-мишеней, консервативных для всех169