Biochemische Charakterisierung der siRNA-vermittelten Erkennung ...

A Anhang
Å
Ångström
µF Mikrofarad
µg Mikrogramm
µl Mikroliter
µm Mikrometer
µM Mikromol pro Liter
µmol
Mikromol
Ω
Ohm
◦ C
Grad Celsius
A.3 Abbildungsverzeichnis
2.1 Wirkmechanismen der siRNA- und miRNA-vermittelten RNAi . . . . . . . . . 9
2.2 Struktur eines Argonaute Proteins . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
2.3 Die N-terminale Domäne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
2.4 Die PAZ Domäne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
2.5 Die Mid Domäne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
2.6 Die PIWI Domäne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
2.7 Schema des minimalen RNAi-Prozesses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22
2.8 Strukturelle Momentaufnahmen des T. thermophilus Ago Proteins während der
RNAi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
2.9 Kinetische Kontrollpunkte der Assemblierung und Funktion des RISC . . . . . 26
2.10 Struktur des dsRBM und Interaktion mit dsRNA . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
2.11 Domänenorganisation von TRBP Isoform 2 und PACT . . . . . . . . . . . . . . 30
2.12 Strukturmodell des RLC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
4.1 Schematischer Aufbau eines Fluoreszenzspektrometers . . . . . . . . . . . . . . 78
4.2 Schematischer Aufbau einer stopped ow Anlage . . . . . . . . . . . . . . . . . 80
4.3 Schematischer Aufbau einer DLS-Apparatur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
5.1 Übersicht über die in dieser Arbeit verwendeten hAgo2-Fusionskonstrukte . . . 86
5.2 Expression verschiedener hAgo2-Fusionsproteine . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88
5.3 Vektorkarten der GST-hAgo2-Fusionskonstrukte . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
5.4 Expression von GST-hAgo2-Fusionsproteinen unter optimierten Bedingungen . 91
5.5 Expression von hTRBP-His . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92
5.6 Präparation verschiedener hAgo2-Fusionsproteine aus inclusion bodies . . . . . 94
5.7 Anitätschromatographische Reinigung von His-hAgo2 und hAgo2-His . . . . . 97
5.8 Gröÿenauschlusschromatographie von hAgo2-His und His-hAgo2 . . . . . . . . . 98
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