Biochemische Charakterisierung der siRNA-vermittelten Erkennung ...

3.8 Nukleinsäuren
si2B passenger gcc uca gca cgu acc ucu aTT ICAM-1 [182]
guide uag agg uac gug cug agg cTT
asLam guide ugu ucu ucu gga agu cca gTT Lamin A/C [242]
sLam passenger cug gac uuc cag aag aac aTT Lamin A/C [242]
siLam passenger cug gac uuc cag aag aac aTT Lamin A/C [242]
guide ugu ucu ucu gga agu cca gTT
asGL3 guide ucg aag uac uca gcg uaa gTT GL3 [243]
as2B-FAM guide uag agg uac gug cT * g agg cTT ICAM-1 [182]
s2B-BHQ passenger gcc T * ca gca cgu acc ucu aTT ICAM-1 [182]
si2B-FAM passenger gcc uca gca cgu acc ucu aTT ICAM-1 [182]
guide uag agg uac gug cT * g agg cTT
sLam-Alexa488 passenger cug gac uuc cag aag aac aTT * Lamin A/C [242]
FAM-asLam guide * ugu ucu ucu gga agu cca gTT Lamin A/C [242]
FAM-siLam passenger cug gac uuc cag aag aac aTT Lamin A/C [242]
guide
* ugu ucu ucu gga agu cca gTT
19mer-FAM
ugu ua * u aau uau ugu aua c
*
T
T
Position des Fluorophors oder Fluoreszenzlöschers
Substitution des u durch ein mit einem C 6-gekoppelten 5/6-FAM-Thymidin
Substitution des u durch ein BHQ1-Thymidin
3.8.3 In vitro Transkript
Name Templat Sequenz (5' → 3') Länge (nt)
ICAM-1-IVT pG-si2B(+)-NotI ggg cga auu ggg ccc gac guc gca 140
ugc ucc cgg ccg cca ugg ccg cgg
gau uag ccg cag uca uaa ugg gca
cug cag gcc uca gca cgu acc ucu
aua acc gcc agc gga aga uca aga
aau aaa uca cua gug cgg cc
Erkennungssequenz der as2B ist unterstrichen
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