Biochemische Charakterisierung der siRNA-vermittelten Erkennung ...

A.4 Tabellenverzeichnis
A.4 Tabellenverzeichnis
2.1 Argonaute-ähnliche und PIWI-ähnliche Proteine und ihre Funktion in verschiedenen
Organismen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
2.2 Kinetische Parameter der Katalyse durch RISC in verschiedenen experimentellen
Systemen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
4.1 Für die Amplikation von DNA-Fragmenten verwendete Primer sowie Temperaturprole
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51
4.2 Agarosekonzentrationen für die Agarose-Gelelektrophorese in Abhängigkeit der
Nukleinsäurelänge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52
4.3 Acrylamidkonzentrationen für die nicht-denaturierende PAGE in Abhängigkeit
der Nukleinsäurelänge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53
4.4 Acrylamidkonzentrationen für die denaturierende PAGE in Abhängigkeit der
Nukleinsäurelänge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
4.5 Für die Analyse von Bakterienkolonien mittels PCR verwendete Primer sowie
das Temperaturprol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
4.6 Für die Sequenzierung von Klonen verwendete Primer sowie das Temperaturprol
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58
4.7 Länge der Banden der radioaktiven Nukleinsäure-Gröÿenmarker . . . . . . . . . 62
4.8 Zusammensetzung von Sammel- und Trenngel sowie Prozentigkeit des Trenngels
in Abhängigkeit vom Trennbereich . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66
4.9 Versuchsbedingungen für die Immundetektion verschiedener Epitope . . . . . . 69
4.10 Versuchsbedingungen für die Expression verschiedener Proteine . . . . . . . . . 70
4.11 Puerzusammensetzung für die Präparation von hAgo2 aus inclusion bodies . . 71
4.12 Pufferzusammensetzung für die Reinigung von GST-hAgo2 bzw. GST-hAgo2-
His unter nicht-denaturierenden Bedingungen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72
4.13 Puerzusammensetzung für die Reinigung von hTRBP-His unter nicht-denaturierenden
Bedingungen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
4.14 Funktionell untersuchte Proteine mit zugehörigen Puern . . . . . . . . . . . . 76
5.1 Getestete Bedingungen für die nicht-denaturierende Reinigung von hAgo2-His . 95
5.2 Übersicht über die biochemischen und kinetischen Parameter bei Bildung eines
binären Komplexes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 134
5.3 Zusammenfassung der Ratenkonstanten der Assoziationsreaktion von binärem
GST-hAgo2/guide RNA-Komplex und target RNA mit drei unabhängigen experimentellen
Ansätzen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140
5.4 Übersicht über die biochemischen und kinetischen Parameter bei Bildung eines
ternären Komplexes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144
235