3. Uluslararası Beyaz Et Kongresi

S 16 Broyler Üretiminde Salmonella Infantis’in Epidemiyolojik
Tiplendirmesi için Ribotiplendirme Yönteminin Kullanılması
Özlem Şahan, K. Serdar Diker, Mehmet Akan
Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Dışkapı, Ankara,
Türkiye
Özet
Bu çalışmada belirli bir bölgede bulunan broyler entegrelere ait kümeslerden izole edilen
Salmonella Infantis’in moleküler epidemiyolojisinin aydınlatılması amaçlandı. Bu doğrultuda
6 farklı entegreden toplanan altlık ve toz örneklerinden izole ve identifiye edilen toplam 176 S.
Infantis izolatı kullanıldı. İzolatlar, ribotiplendirme yöntemiyle PvuII restiriksiyon endonükleaz
enzimiyle daha küçük fragmentlere parçalandı ve bu parçalar jel elektroforeziyle birbirinden
ayrıldı. Ayrılan fragmentler jelden membrana transfer edildi ve 16S ve 23S rRNA operonuna
spesifik kemilüminesans substratla işaretli prob yardımıyla hibridizasyona tabi tutuldu.
Hibridizasyondan sonra bant profilleri elde edildi. Ribopattern denilen bu bantlar, referans bir
veri bankasıyla karşılaştırılarak izolatların tanımlanması için kullanıldı. Ribotiplendirme ile elde
edilen bantların sayı ve ilişkileri GelCompar TM (Applied Maths, Ghent, Belgium) jel analiz
programı kullanılarak; küme analizi Dice benzerlik katsayısı ve UPGMA (Unweighted Pair
Group Method Average) ilişki kuralı parametreleriyle değerlendirildi. Yapılan analiz sonucunda
ribotiplendirme yöntemi, bir kümes içindeki altlık ve toz örneklerinden izole edilen suşların
benzer olup olmadığını gösterdi böylelikle suşların entegre içi veya entegreler arası bulaşması
konusunda yorum yapabilmeyi sağladı. Bir bölgede bulunan aynı ve farklı entegrelere ait
suşların benzerliği ortaya kondu. Ayrıca suşların, küçük ölçekli bölgelerde bulunan kümeslere
ait olup olmadığı anlaşıldı. Bu sonuçlar çerçevesinde yöntemin suşların epidemiyolojik ayrımını
yapabilme kabiliyetinde olduğunu gösterdi.
Anahtar kelimeler: Broyler, ribotiplendirme, Salmonella Infantis
Giriş
Soğuk kanlı hayvanlardan insana kadar çok geniş bir konakçı dizgesine sahip olan Salmonella
suşları, dünyada en yaygın gıda kökenli hastalık etmenleridir. Bazı serotipler konakçı spesifik
özellik göstermekle birlikte büyük çoğunluğu çapraz enfeksiyonlara neden olmaktadır. Bu
özelliklerinden dolayı tüm sıcak kanlı hayvan orijinli Salmonella serotipleri insan için potansiyel
patojen olarak tanımlanmaktadır. Günümüzde S. Typhimurium ve S. Enteritidis insanda
Salmonellozis’e yol açan en yaygın serotiplerdir. Ancak son yirmi yılda özellikle gelişmişα
ya da gelişmekte olan ülkelerde yürütülen çalışmalarda bu iki serotipin baskınlığının giderek
azaldığı ve S. Infantis basta olmak üzere, başka serotiplerin sıklığının arttığı tespit edilmiştir
(3,9,15,16).
İnsanlardaki S. Infantis salgınlarının öncelikli rezervuarı olarak hayvanlar özellikle de kanatlı
popülasyonu gösterilmektedir. Bunun üzerine Avrupa’da European Food Safety Authority
(EFSA) tarafından yapılan tarama çalışmalarında S. Infantis’in broyler çiftliklerinden kaynak
aldığı ortaya konulmuştur. En yüksek oranla Macaristan (%87), bunu Polonya (%19) ve Çek
Cumhuriyeti (%13) takip etmiştir (EFSA 2007a; 2007b). Almanya’da ise broyler sürülerinde S.
120