3. Uluslararası Beyaz Et Kongresi

S 52 Tavuklarda İnfeksiyöz Bronşitis Virüsünün (AvCoV-IBV) TaqMan
Real Time RT-PCR ile Hızlı Saptanması ve S1 Geni Varyasyonunun
Filogenetik Analizi
Yılmaz, H. 1 , Altan E 1 , Çizmecigil, U. 1 , Gürel, A. 2 , Öztürk G. 2 , Erdoğan Ö. 2 , Çetinkaya B. 3 ,
Turan, N. 1
1
İstanbul Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Viroloji Anabilim Dalı, Avcilar, Istanbul
2
İstanbul Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Patoloji Anabilim Dalı, Avcilar, Istanbul
3
Fırat Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Elazığ
Özet
Tavuklarda yoğun yetiştirme ve aşılamalar gibi stres faktörleri direncin düşmesine, infeksiyöz
etkenlerin yerleşmesine ve birbirlerini tetiklemesine neden olmaktadır. Bu etkenlerden infeksiyöz
bronşitis virüsü (AvCoV-IBV) RNA’lı bir virus olması nedeniyle genetik değişime yatkındır ve
varyant suşlar oluşabilir.
Avrupa Birliği COST-1207 aksiyonu çerçevesinde TÜBİTAK (Proje No: 113O411) tarafından
desteklenen bu çalışmada, infeksiyöz bronşitis virüsünün yumurtacı ve broylerlerde hızlı tanısı,
izolasyonu ve S1 geni varyant infeksiyöz bronşitis virüslerinin sekans ve filogenetik analizleri
amaçlandı. Bu amaçla, Marmara, Batı Karadeniz, Akdeniz ve İç Anadolu bölgesindeki 14
yumurtacı kümesteki tavuklardan alınan trakeal svablar ve 38 broyler kümesteki solunum
problemleri olan broylerlerden alınan trakeal doku (her kümesten 4) örnekleri IBV varlığı
yönünden TaqMan real time RT-PCR ile araştırıldı. IBV’unun hızlı saptanması amacıyla
Prob reaksiyonlu real-time RT-PCR (Callison ve ark. 2006) kullanıldı. C T
değeri düşük olan
örneklerden 9-11 günlük embryolu SPF yumurtalara ekimler yapıldı. Saptanan sirrusların (C T
değeri düşük) Dr. I. Monne (kişisel görüşme) ve Worthington ve ark., (2008) tarafından S1 geni
için tasarlanan primerler ile kısmi sekans analizi yapıldıktan sonra ülkemiz ve diğer ülkelerden
bildirilen IBV sekansları ile karşılaştırılarak soyağacı oluşturuldu. Ayrıca alınan doku örnekleri
histopatolojik olarak incelendi.
TaqMan Real-Time RT-PCR ile 9 yumurtacı ve 29 broyler kümeste IBV pozitifliği saptandı.
Saptanan bu viruslardan 7 yumurtacı kümese ve 18 broyler kümese ait sekanslanabilen IBV
virüslerinin S1 geni kısmi sekans analizleri ve soyağacı verilerine göre 3 broyler kümeste
saptanan IBV’ların IS/236 izolatı (%99,7), Ma5 suşu (%99,2- 99,7), China-W93 izolatı (%99-
99,5), H120 suşu (%99-99,5), NGA/310/2006 suşu (%99,5-100), Mass41 suşu (%97,5-98,1),
Connecticut vaccine suşu (%96,4-96,9) ve Florida 18288 suşu (%95,9-96,4) ile benzer olduğu
görüldü. Ayrıca 15 broiler kümeste saptanan IBV’ların Türkiye’den daha önce rapor edilen IB
viruslarına benzer olarak İsrail Varyant-2 suşları (KF007927, EU780077, JX027070, JX173488)
ile %94,9-99,7 oranında benzerlik gösterdiği belirlendi. Buna karşın 7 yumurtacı kümeste
saptanan IBV’ların bu çalışmada broylerlerde saptananlardan farklı, fakat İran, Hindistan ve
Çin’den bildirilen suşlar ve 4/91 ile aynı gen grubunda bulunan İsrail Varyant 1’e benzer (%95.1-
% 99.1) olduğu belirlendi.
Sonuç olarak, S1 geni açısından farklı IBV suşlarının (aşı virusları dahil) sahada sirküle
olduğu görülmektedir. Bu virüslerde oluşacak mutasyon veya kendi aralarında oluşabilecek
rekombinasyon sonucu yeni varyant sirrusların ortaya çıkabileceği ve sahada farklı problemlere
407