Les mondes darwiniens

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[gu i llau m e lecoi ntr e / filiation]
« primitifs » en un organisme virtuel pourrait être avantageusement qualifiée
de « carte » en remplacement de la métaphore du plan. En effet, il s’agit avant
tout de montrer une combinaison d’attributs et leurs connexions entre eux. La
carte ne porte pas en elle-même d’idée d’intention à l’origine de l’être qui est
montré, elle est une simple représentation schématique et utilitaire de ce qui
est. Cependant, même dans ce cadre-là, si la carte prétend schématiser ce qui
est, il faudrait alors qu’elle représente un organisme concret en le nommant,
et non une combinaison idéale de caractères.
Parce qu’elle fige la nature dans des étapes imaginaires là où, partout, il n’y
a que transformations continues et réversibles, la notion de plan est impropre
à une approche phylogénétique du vivant : un organisme n’est pas le reflet
d’un plan idéel, mais une mosaïque unique de caractères qui est le fruit de la
contingence de son histoire évolutive.
3 La construction de l’arbre : Willi Hennig
Entre 1859 et 1950, on sait dessiner des arbres mais on ne sait pas construire
d’arbre. On dispose bien, depuis Darwin (1859), du niveau théorique (celui
de la généalogie présumée du vivant) mais pas du niveau pratique (comment
fait-on ?). Willi Hennig, entomologiste allemand, publie sa systématique phylogénétique
en 1950 en allemand, mais ne sera entendu de la communauté
internationale qu’en 1966 lors de la traduction de son livre en anglais31 . Quatre
principes fondamentaux caractérisent la pensée hennigienne : (i) on ne classe
jamais qu’un échantillon précis d’espèces ; (ii) seuls les traits dérivés, innovants
au sein de l’échantillon, peuvent conduire à un regroupement taxonomique
reflétant l’apparentement ; (iii) pour savoir si un trait est dérivé, il faut polariser
le caractère concerné, c’est-à-dire aller voir dans quel état il est dans l’extragroupe
(et faire cela pour tous les caractères disponibles) ; (iv) les groupes
paraphylétiques ou polyphylétiques ne sont que des artefacts classificatoires
fondés sur des traits primitifs partagés ; et une taxonomie phylogénétique ne
doit admettre que les groupes monophylétiques (clades).
3.1 Construction des caractères
En systématique, on pratique la biologie comparée qui consiste à détecter
la ressemblance entre les structures présentées parmi un échantillon d’organismes,
en les comparant entre eux. On utilise une grille de lecture théorique
31. Hennig (1966), Phylogenetic Systematics, University of Illinois Press @.