Les mondes darwiniens

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[les mon des darwiniens]
populations offre également les conditions nécessaires à l’étude des processus
de mutations qui est un objectif important de ces travaux (cf. annexe 2).
Alors qu’une difficulté majeure liée au concept de fitness est de déterminer
comment on peut mesurer une fitness, le dispositif expérimental de Lenski est
particulièrement habile car il utilise une mesure simple et peu discutable. Il
mesure en effet la fitness relative de deux clones en les mettant simplement
en compétition dans un milieu défini. Cette mesure simple est possible car
il utilise une souche qui est purement clonale 32 (en l’absence complète de
recombinaison 33 ). Cette absence de recombinaison permet également de tracer
génétiquement les clones mis en compétition. Pour mesurer l’évolution
de la fitness au sein d’une lignée, il utilise la possibilité de « résurrection » des
bactéries quand elles sont conservées congelées, mélangées à du glycérol,
dans de l’azote liquide. En conservant ainsi des réplicats de la souche à différents
stades de l’expérimentation, il peut mesurer l’évolution de la fitness au
sein d’une lignée mais également entre les réplicats d’une expérimentation
(cf. annexe 3).
Il est important de souligner que le concept de fitness relative utilisé par
Lenski répond à notre demande de minimalisme au sens où il est moins chargé
de théorie que les concepts de fitness couramment utilisés, et joue pour lui un
rôle probablement moins central que pour Lewontin. Cependant, comme nous
l’avons souligné, Lenski n’exprime aucune formalisation précise de la théorie
de l’évolution. Il teste en revanche explicitement les prédictions des modèles
de la génétique des populations. Enfin, le dispositif expérimental étant avant
tout conçu pour tester la répétabilité des événements de sélection, ainsi que
les processus de mutation, le rôle de la dérive génétique est minimisé.
3 La théorie de l’évolution aujourd’hui :
proposition de formalisation
Au cahier des charges de la théorie de l’évolution, qui est d’expliquer la diversité
des organismes de l’histoire de la vie ainsi que les adaptations des
organismes, on peut raisonnablement ajouter, comme nous l’avons vu, l’explica-
32. Une souche purement clonale est ici un ensemble de bactéries issues du même
ancêtre et possédant donc toutes les mêmes gènes.
33. La recombinaison est l’échange de gènes soit au cours de la reproduction, soit
par des transferts lors de contacts. Un événement de recombinaison supprime le
caractère purement clonal d’une lignée de bactéries issues d’une même souche.