31.05.2018 Views

4. Uluslararası Beyaz Et Kongresi

Bildiriler Kitabı

Bildiriler Kitabı

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

Son yıllarda yapılan çalışmalarda, L. monocytogenes izolatlarının moleküler karakterizasyonunda;<br />

ERIC-PCR parmak izi metodunun pratik, ekonomik ve yüksek güvenirliliğe sahip olması gibi<br />

avantajları nedeniyle DNA analizlerinde kullanılabileceği bildirilmiştir. Yöntem, tek bir bakteri<br />

türünde net bir DNA parmak izinin oluşturulması için kullanılabilmektedir (6,7).<br />

Bu çalışmada bir yıl boyunca çeşitli kanatlı mezbahalarından toplanan toplam 121 adet piliç<br />

boyun derisi örneklerinden L. monoytogenes izolasyonu, PCR ile izolatların doğrulanması,<br />

multipleks PCR ile serotip tayinlerinin yapılması ve elde edilen L. monocytogenes izolatlarının<br />

ERIC-PCR parmak izi analizi ile genetik yakınlıklarının belirlenmesi amaçlanmıştır.<br />

Materyal ve Metot<br />

Örnek toplama :On iki aylık bir periyotta, üç farklı kanatlı kesimhanesine yapılan aylık<br />

ziyaretlerde toplam 121 adet piliç boyun derisi L. monocytogenes izolasyonu amacıyla<br />

toplanmıştır. Boyun derisi örnekleri mezbahada kesim aşamasında paketleme öncesinde steril<br />

makas ve pens yardımı ile steril numune poşetlerine alınarak soğuk zincir altında laboratuvara<br />

getirilmiştir.<br />

Listeria monocytogenes izolasyonu :Karkas sürüntü örnekleri ve 10 g boyun derisi örnekleri<br />

90 ml Half Frasier Broth (Oxoid CM895, SR156) ile filtreli steril numune torbalarına konulup<br />

homojenize edildikten sonra 30ºC’de 24 saat inkübe edilmiştir. Çalışmada, L. monocytogenes<br />

izolasyonu amacıyla immuno manyetik separasyon (IMS) bazlı kültür tekniği kullanılmıştır.<br />

IMS ile zenginleştirilmiş materyal, MOX Agarın (Modifiye Oxford Agar; Oxoid CM 856, SR<br />

140) ve Kromojenik Listeria Agara (Chromogenic Listeria Agar (ISO) Base, Oxoid CM1084;<br />

OCLA (ISO) Differential Supplement, SR0244E; OCLA (ISO) Selective Supplement, SR0226E)<br />

çizildikten sonra, petriler 35-37ºC’de 24-48 saat inkübe edilmiştir. İnkübasyonu takiben, MOX<br />

ve Kromojenik Listeria Agarda üreyen şüpheli kolonilerden 1-5 adet seçilerek biyokimyasal<br />

ve diğer testler yapılmak üzere, TSA-YE’ye (Tryptic Soy Agar-Yeast Extract; Oxoid CM 131)<br />

geçildikten sonra plaklar 30°C’de 24 saat inkübe edilmiştir. Üreyen kolonilere sırası ile; Gram<br />

boyama, katalaz (%3’lük H 2<br />

O 2<br />

ile), oksidaz (Bactident oxidase, Merck 113300) ve 20-25°C’de<br />

SIM mediumda (Sulfide Indole Motility Medium; Merck 5470) hareketlilik, CAMP, nitrat<br />

redüksiyon ve karbonhidrat fermentasyon testleri (mannitol, ramnoz ve ksiloz) yapılmıştır.<br />

İdentifiye edilen L. monocytogenes izolatları, TSB-YE’de 4°C’de, gliserinli kriyovialler ise<br />

-86°C’de dondurularak saklanmıştır.<br />

L. monocytogenes izolatlarının PCR ile doğrulanması. İzolatların PCR ile analizinde DNA<br />

ekstraksiyonu yapılmış ve pozitif kontrol olarak kullanılan L. monocytogenes ATCC 7644<br />

referans suşu ile PCR koşulları optimize edilmiştir. Çalışmada, L. monocytogenes için hlyA<br />

gen sekansını oluşturan (PCRGO: 5’ GAA TGT AAA CTT CGG CGC AAT CAG 3’; PCRDO:<br />

5’ GCC GTC GAT GAT TTG AAC TTC ATC 3’) (hlyA [listeriolysin-O] 388 bp) primer çifti<br />

kullanılmıştır. %1.5’luk agaroz jelde, 100 Volt elektirik akımında elektroforez işleminin ardından<br />

sonuçlar UV ışığı altında değerlendirilmiştir.<br />

Multipleks PCR ile L. monocytogenes’lerin Serotiplerinin Belirlenmesi: Piliç boyun derisi<br />

örneklerinden izole edilen ve PCR ile doğrulanan L. monocytogenes izolatlarının serotiplendirilmesinde<br />

Doumith ve ark. (8) tarafından geliştirilen primerler ve multipleks PCR tekniği kullanılmıştır. Buna<br />

göre; i) 691 bp ağırlığında bant veren örnekler serotip 1/2a (3a), ii) 471 bp ağırlığında bant veren<br />

örnekler serotip 1/2b (3b), iii) 691 ve 906 ağırlığında bant veren örnekler 1/2c (3c), iv) 471 ile 597 bp<br />

ağırlığında bant veren örnekler serotip 4b (4d, 4e) olarak değerlendirilmiştir.<br />

542

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!