4. Uluslararası Beyaz Et Kongresi

ERIC-PCR (Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus-PCR) parmak izi analizi:L.
monoctogenes izolatlarının parmak izi analizi ve aralarındaki klonal ilişki ERIC-PCR ile
belirlenmiştir. Analizde ERIC1R (5’-ATGTAAGCTCCT GGG GATTCAC-3’) ve ERIC2
(5’-AAGTAAGTGACTGGGGTGAGC G-3’) primerleri kullanılmış olup, L. monocytogenes
genomik DNA’ları DNA purifikasyon kiti kullanılarak izole edilmiştir. ERIC-PCR analizi Chen
ve ark. (6) tarafından belirtilen metoda göre yapılmıştır.
Cluster (küme) analizi:L. monocytogenes izolatlarının genomik parmak izlerinin benzerliğinin
(klonal ilişki) belirlenmesinde ERIC-PCR analizi sonucunda elde edilen paternler kullanılmıştır.
Verilerin oluşturulup analize alınmasında her bir izolat için bantlar var (1) ya da yok (0) olarak
kaydedilmiştir. Veriler, DendroUPGMA dendrogram oluşturma uygulamasında işlenerek
izolatların benzerlik ve uzaklık matriksleri Jaccard katsayısına (Jaccard’s coefficient) göre
hesaplanarak dendrogramları oluşturulmuştur.
Bulgular
Çalışmada 121 piliç boyun derisi örneğinin 10’undan 18 L. monocytogenes kolonisi IMS bazlı
kültür tekniği ile izole edilmiştir (Tablo 1). 121 piliç boyun derisi örneğinin 10’unun (%8.3)
L. monocytogenes ile kontamine olduğu belirlenmiştir. Multipleks PCR ile yapılan serotip
analizinde ise, hlyA geni tespit edilmiş olan (Şekil 1) 18 izolattan 15’i (%83.3) 1/2a (3a) serotipi,
3’ü ise (%16.7) 1/2b (3b) serotipi olarak identifiye edilmiştir. Buna göre L. monocytogenes ile
kontamine olduğu belirlenen 10 piliç boyun derisi örneğinin 8’inden 1/2a (3a), 2’sinden 1/2b
(3b) serotipleri tespit edilmiştir (Tablo 1).
Tablo 1. Piliç örneklerinden tespit edilen L. monocytogenes izolatlarının dağılımı ve
karakterizasyonu
Örnek No Mezbaha IMS bazlı kültür
İzolat kodu
PCR
hlyA
PCR
Serotip
ERIC-PCR
Grup no
P10 Bolu (C) LM-P10-1 + 1/2a (3a) Grup-2
LM-P10-2 + 1/2a (3a) Grup-2
P20 Bolu (C) LM-P20-1 + 1/2a (3a) Grup-2
LM-P20-2 + 1/2a (3a) Grup-2
P41 Sakarya-Söğütlü (D) LM-P41-1 + 1/2a (3a) Grup-2
LM-P41-2 + 1/2a (3a) Grup-5
P48 Sakarya-Söğütlü (D) LM-P48-1 + 1/2b (3b) Grup-6
P51 Sakarya-Söğütlü (D) LM-P51-1 + 1/2b (3b) Grup-5
LM-P51-2 + 1/2b (3b) Grup-5
P70 Bolu (G) LM-P70-1 + 1/2a (3a) Grup-7
P75 Bolu (G) LM-P75-1 + 1/2a (3a) Grup-8
P77 Bolu (G) LM-P77-1 + 1/2a (3a) Grup-7
P78 Bolu (G) LM-P78-1 + 1/2a (3a) Grup-7
LM-P78-2 + 1/2a (3a) Grup-7
LM-P78-3 + 1/2a (3a) Grup-7
LM-P78-4 + 1/2a (3a) Grup-7
P80 Bolu (G) LM-P80-1 + 1/2a (3a) Grup-7
LM-P80-2 + 1/2a (3a) Grup-7
543