MDCK-MRP2 - Dkfz

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Forschungsschwerpunkt B
Funktionelle und Strukturelle Genomforschung
die Simulation von Hefezellen - Teilung und Paarung - eine
wichtige Forschungsrichtung dar, konnte dadurch das erste
Mal gezeigt werden, daß die 3D-Zellsimulation, die Gene-
O-Matic zugrunde liegt, auch für einzellige Organismen gewinnbringend
eingesetzt werden kann. Im Rahmen dieser
Projekte wurde die Software “Gene-O-Matic” weiter ausgebaut
und benutzerfreundlicher gemacht. Außerdem wurde
dazu eine Erfindungsmeldung gemacht.
Der zweite Bereich, die Analyse von Zelllinien, führte zur
Entwicklung der Software “ALES” und der neuen Version
“Ales-Lite”. Mit diesen Programmen ist es möglich, vorhandene
Zelllinien bzgl. der Anzahl an Ereignissen zu untersuchen,
die notwendig sind, um aus einer Eizelle die ganze
Zelllinie aufzubauen. Außerdem ermöglicht ALES die Generierung
zufälliger Zelllinien nach verschiedenen
Wahrscheinlichkeitsmodellen. Der Vergleich zufälliger und
beobachteter Zellinien erlaubt es, Aussgen über die Effizienz
oder Komplexität eines Entwicklungsprozesses zu machen.
Untersucht wurden vor allem Nematoden, aber auch
andere Organismen. Diese Arbeit wurde in Zusammenarbeit
mit R.B. Azevedo von der University of Houston in
Houston, Texas, durchgeführt. Ein Teil der Arbeit wurde
auch dort gemacht.
Abteilung B010
Medizinische und Biologische Informatik
DKFZ 2004: Wissenschaftlicher Ergebnisbericht 2002 - 2003