MDCK-MRP2 - Dkfz

Forschungsschwerpunkt B
Funktionelle und Strukturelle Genomforschung Übersicht
Forschungsschwerpunkt Funktionelle und Strukturelle Genomforschung
Sprecherin: Prof. Dr. (PhD) Annemarie Poustka
Medizinische und Biologische Informatik (B010)
Prof. Dr. sc.hum. Hans-Peter Meinzer
Tel.: 06221 42-2366, FAX 06221 42-2345
e-mail: H.P.Meinzer@DKFZ.de
Molekulare Biophysik (B020)
Prof. Dr. rer. nat. Sándor Suhai
Tel.: 06221 42-2369, FAX 06221 42-2333
e-mail: S.Suhai@DKFZ.de
Tumorgenetik (B030)
Prof. Dr. rer. nat. Manfred Schwab
Tel.: 06221 42-3220, FAX 06221 42-32 81
e-mail: M.Schwab@DKFZ.de
Biophysik der Makromoleküle (B040)
Prof. Dr. rer. nat. Jörg Langowski
Tel.: 06221 42-3390, FAX 06221 42-3391
e-mail: Joerg.Langowski@DKFZ.de
Molekulare Genomanalyse (B050)
Prof. Dr. habil. (PhD) Annemarie Poustka
Tel.: 06221 42-4742, FAX 06221 42-3454
e-mail: A.Poustka@DKFZ.de
Molekulare Genetik (B060)
Prof. Dr. rer. nat. Peter Lichter
Tel.: 06221 42-4609, FAX 06221 42-4639
e-mail: Peter.Lichter@DKFZ.de
Funktionelle Genomanalyse (B070)
Dr. rer. nat. Jörg Hoheisel
Tel.: 06221 42-4680, FAX 06221 42-4682
e-mail: J.Hoheisel@DKFZ.de
Theoretische Bioinformatik (B080)
Dr. rer. nat. Roland Eils
Tel.: 06221 42-3600, FAX 06221 42-3610
e-mail: R.Eils@DKFZ.de
Zentrale Spektroskopie (B090)
William E. Hull PhD
Tel.: 06221 42-4515, FAX 06221 42-4554
e-mail: W.Hull@DKFZ.de
Zentrale Proteinanalytik (B100)
Dr. rer. nat. Martina Schnölzer
Tel.: 06221 42-4599, FAX 06221 42-4562
e-mail: M.Schnoelzer@DKFZ.de
Um eine effizientere Zusammenarbeit sämtlicher im engeren
Sinne der Genomforschung zuzuordnenden Abteilungen
zu gewährleisten, wurden 1996 die Aktivitäten zur
Genlokalisation, der genetischen Kartierung, der Bioinformatik
und vor allem der funktionellen Analyse krebsrelevanter
Genombereiche, die bis dahin auf verschiedene
Forschungsschwerpunkte verteilt waren, im Forschungsschwerpunkt
„Genomforschung und Bioinformatik“ zusammengefaßt.
Die theoretisch arbeitenden Arbeitsgruppen
des Schwerpunkts verbinden ihre Ansätze aus der Mathematik,
Statistik, Physik und Informatik mit computergestützten
Simulationsverfahren und schlagen dadurch eine Brükke
zwischen diesen theoretischen Disziplinen und den experimentellen
Arbeitsrichtungen der Krebsforschung. Durch
Kooperationen mit zahlreichen Abteilungen des DKFZ finden
die methodischen Entwicklungen des Schwerpunktes
direkten Einsatz in der molekularen und genomischen Strukturforschung,
in der Krebsdokumentation und in der medizinischen
Bildverarbeitung.
In der Abteilung Molekulare Genetik werden die zweiund
dreidimensionale Struktur des menschlichen Genoms
sowie die tumorspezifischen Veränderungen dieser Struktur
untersucht. Die räumliche Organisation des Genoms
innerhalb der Zellkerne wird in Beziehung zur Genexpression,
d.h. in Hinsicht auf eine funktionelle Zellkernarchitektur,
untersucht. Die Analyse von tumorassoziierten genomischen
Veränderungen zielt auf die Identifikation von
genetisch definierten Krankheitssubentitäten und auf die
Isolation und Charakterisierung von pathogenetisch relevanten
Genen mit onkogenem Potential. Ein wichtiger Aspekt
ist auch die Entwicklung neuer Methoden mit Schwerpunkt
auf DNA-Chip-Technologie für die Analyse genomischer
Imbalancen.
Ziel der Abteilung Molekulare Genomanalyse ist die systematische
Erforschung der molekularen Ursachen menschlicher
Krankheiten. Der Schwerpunkt liegt hierbei auf Krebserkrankungen.
Das Verständnis monogener und komplexer
Krankheitsprozesse wird durch die detaillierte funktionelle
Analyse menschlicher Gene und ihrer Genprodukte
fortschreitend erweitert. Hochdurchsatztechnologien zur
funktionellen Genomik und Proteomik werden in der Abteilung
gezielt entwickelt und ständig optimiert, die in Experimenten
gewonnenen Daten durch Einsatz integrierter
Bioinformatik ausgewertet und analysiert. In der Abteilung
wurde eine Funktions-Pipeline etabliert, die von der Identifizierung
potentiell krankheitsrelevanter Gene mittels
cDNA-Microchips und Genexpressionsprofilen, über die systematische
Sequenzanalyse humaner Gene (Deutsches
cDNA Konsortium), bis zur Herstellung automatisierter
zellulärer Testsysteme zur funktionellen Charakterisierung
der Genprodukte reicht. Die öffentlich zugängliche Datenbank
LIFEdb wurde entwickelt, um die hier generierten
Informationen der Wissenschaftsgemeinschaft zur Verfügung
zu stellen.
Die Arbeiten der Abteilung Funktionelle Genomanalyse
zielen auf die Entwicklung und unmittelbare Anwendung
neuer Technologien zur Produktion und Prozessierung biologischer
Information auf ganz-genomischer Ebene mit dem
Ziel einer Beschreibung und Analyse der zellulären Umsetzung
der genetischen Information und der Regulation dieser
Vorgänge. Ein Schwerpunkt liegt dabei im Gebiet der
DKFZ 2004: Wissenschaftlicher Ergebnisbericht 2002 - 2003
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