MDCK-MRP2 - Dkfz

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Forschungsschwerpunkt B
Funktionelle und Strukturelle Genomforschung
Zentrale Spektroskopie (B090)
Leiter: Dr. William E. Hull, Spezialist für Kernspinresonanz (NMR)
Wissenschaftliche Mitarbeiter
Prof. Dr. Wolf-Dieter Lehmann, Spezialist für
Massenspektrometrie (MS)
Dr. Claus-Wilhelm von der Lieth, Spezialist für Modeling und
Datenbankanwendungen
Technisches Personal
Gabriele Schwebel-Schilling, CL für NMR-Dienstleistung
Gerhard Erben, CTA für Dienstleistung (IR, UV, MS) und
Methodenentwicklung (MS, HPLC)
Sekretariat
Sabrina Zahner (½)
2002-2003 waren folgende zusätzliche Personen über Hausoder
Drittmittel-Zeitverträge (H oder D) oder ohne Vergütung (N)
in der ZS an verschiedenen Forschungsprojekten tätig:
Wissenschaftliche Mitarbeiter
Dr. Dieter Albert (H 1/01 - 8/03)
Dr. Andreas Bohne-Lang (D 1/01 - 12/03)
Dr. Martin Frank (D 6/01 - 12/03)
Dr. Ralf Krüger (D 1/03 - 12/06)
Gastwissenschaftler
Dr. Marina Edelson-Averbukh, Technion, Haifa, Israel (Minerva
Stiftung, 5/03 - 4/05)
Prof. M. Remko, Department of Pharmaceutical Chemistry,
Comenius University, Bratislava, Slowakei (H 1/03 - 4/03)
Dr. Junhua Wei, Changchun Institute of Applied Chemistry,
Changchun, P.R.China (H 10/02 - 9/04)
Doktoranden
Karin Bettinger (H 8/02 - 3/05)
Chokri Hassayoun (D 1/02 - 6/03)
Klaus Lohmann (D 5/01 - 12/04)
Alexander Loß (D 1/01-1/03; 1/04 - 12/04)
Thomas Lütteke (H 10/01 - 9/04)
Mogjiborahman Salek (H 2/01 - 1/04)
Andreas Schlosser (H - 3/02; mit Abt. A060)
Mathias Wind (H 1/00 - 12/02)
Diplomand
Oliver Held (N 2 - 7/02)
Studentische Hilfkräfte
Franziska Becker (D 6/03 - 12/04)
Michael Clark (D 9/01 - 6/02)
Matthias Fleischer (D 9/01 - 12/04)
Jan Kerschgen (D 2/03 - 12/04)
Externe Verträge
Peter Gutbrod (D 9/01- 6/03)
B090
Zentrale Spektroskopie
DKFZ 2004: Wissenschaftlicher Ergebnisbericht 2002 - 2003
Neben der vielfältigen analytischen Dienstleistung (Auftragsmessungen
zur Bestätigung bzw. Aufklärung von
Molekülstrukturen mittels Kernspinresonanz (NMR) und
Massenspektrometrie (MS) wird in der Zentralen Spektroskopie
(ZS) an die Einführung bzw. Entwicklung neuer
Meß- Analyse- und Modelierungsverfahren und ihre
Anwendungen in der Krebsforschung intensiv gearbeitet.
Diese Methoden werden bei eigenständigen bzw.
kooperativen Forschungsaktivitäten in den Bereichen Biochemie,
molekulare Struktur, Dynamik, und Wechselwirkung,
funktionelle Proteomics und Glykomics, sowie
Tumormetabolismus und Tumortherapie eingesetzt.
Die Schwerpunkte der MS-Anwendungen liegen in Protein-
und Peptidanalytik mit nano- bis picomol Mengen
(präzises Molgewichtsbestimmung, Charakterisierung mittels
eines enzymatischen Verdau, Sequenzierung, Bestimmung
von Phosphorylierung und anderen posttranslationalen
Modifikationen) sowie quantitative Bestimmung
von zellulären Phospholipidenprofilen.
Hochfeld-MR-Spektroskopie mit Magnetfeldstärken von
5,7 - 14 Tesla wird für die Entwicklung neuartiger
Pharmaka, für die Identifikation von Naturstoffen mit
krebspräventiver Wirkung, und zur Charakterisierung der
strukturellen und dynamischen Eigenschaften von Peptiden
und Oligosacchariden so wie Protein-Ligand-Wechselwirkungen
eingesetzt. Mit der 31 P- bzw. 19 F-MR-Spektroskopie
können metabolische Eigenschaften von Tumorzellen
in Kultur sowie in vivo (Tiermodell) untersucht.
Bei 7 Tesla ist es auch möglich die nichtinvasive Hochfeld-
MR-Bildgebung einzusetzten, um z.B. das Wachstum von
Tumoren und Metastasen in inneren Organen von
tumortragenden Mäusen zu visualisieren und die Wirkung
einer Therapie zu untersuchen.
Im Internet-Zeitalter ist die Bereitstellung von spektroskopischen
Daten und 3D Molekülstrukturen in Form von
„benutzerfreundlichen“ Datenbanken und Informationssystemen
eine wichtige Dienstleistung. Schwerpunkte im
Bereich „molecular modeling“ sind die Oligosaccharide
(Konformation und Dynamik), Glykoproteine, sowie Protein-Oligosaccharide-Wechselwirkungen
(Lektine, Virusinfektion)
und die Entwicklung neuer Pharmaka.
Die Forschungsaktivitäten der ZS sind in vier thematischen
Bereichen gegliedert (MS-Anwendungen, NMR-Applikationen,
Datenbanken/Internet, und Molecular
Modeling), die im Folgenden näher beschrieben werden.
Unsere Internet-Addresse:
http://www.dkfz-heidelberg.de/zspek/zshome.htm