MDCK-MRP2 - Dkfz

Forschungsschwerpunkt A
Zell- und Tumorbiologie
L-P-C-R, die als Helix-Initiationsstelle wirkt, b) einen Tryptophanrest,
der 8-10 Reste C-terminal davon liegt, der die
β-hairpin Struktur stabilisiert und der für die Kooperativität
entscheidend ist, und c) ein hohes Potenzial für die α-helikale
sowie die β-Faltblattstruktur der dazwischen liegenden
Reste. Versuche einen synthetischen Schalter unter
diesen Kriterien zu schaffen, waren jedoch bisher nicht
erfolgreich. Dies weist auf eine weitere unentdeckte Eigenschaft
hin. In jüngerer Zeit haben wir einige weitere
natürlich vorkommende Konformationsschalter identifiziert
und getestet durch Zugabe von Pyruvatdehydrogease,
Phosphatase und Adenylatzyklase-Regulatorprotein zusätzlich
zu jenen Faktoren, die bereits aus HIV1 gp120 und
Tomaten Polygalacturonase bekannt sind. Dabei konnten
wir ein neues Werkzeug entwickeln, den Seitenketten-
Interaktionsindex (SCII). Dieser stellt einen Parameter für
die Eigenschaft von Seitenketten dar, innerhalb einer Sequenz
energetisch günstige Interaktionen einzugehen. Wir
haben gefunden, dass SCII >0.5 ein weiteres Charakteristikum
für Konformationsschalter ist und einen exzellenten
Prognosefaktor darstellt. Mit der Verwending von SCII als
viertes Charakteristikum, waren wir erstmals in der Lage,
einen voll funktionsfähigen Konformationsschalter zu entwerfen
und synthetisch herzustellen [16]. Dies wiederum
eröffnet die Möglichkeit, dieses Motiv für Proteinkonstruktionen
zu nutzen, bei denen, wie in natürlichen Proteinen,
Protein/Protein- oder Protein/Membran -Assoziation zu
kontrollieren oder signalisieren. In der Zwischenzeit setzen
wir die Suche fort nach weiteren Familien von Konformationsschaltern,
neben jenen mit L-P-C-R. Unsere Entdeckung
des Schalters in der Transaktivierungsdomäne von
p53 (unveröffentlicht) ist ein Hinweis auf die tatsächliche
Existenz solcher Sequenzen.
Kooperationen: Die Erfahrungen auf dem Gebiet der CD-
Analysen der Sekundärstruktur von Proteinen haben zu
einer Reihe Kooperationen geführt, die alle innerhalb des
oben skizzierten Forschungsrahmens angesiedelt sind
[17,18].
Publikationen (* = externer Koautor)
[1] *Breitenlechner, C. B., Gaßel, M., *Hidaka, H., Kinzel, V.,
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[5] *Breitenlechner, C., Gaßel, M., *Engh, R. A., Bossemeyer,
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Abteilung A060
Pathochemie
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DKFZ 2004: Wissenschaftlicher Ergebnisbericht 2002 - 2003
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