MDCK-MRP2 - Dkfz

Forschungsschwerpunkt C
Krebsrisikofaktoren und Krebsprävention
SERVICE: Biometrische Beratung und
Versuchsplanung (C060-04)
W. Rittgen, A. Benner, C. Ittrich, A. Kopp-Schneider,
L. Edler
In Zusammenarbeit mit: Tierschutzbeauftragte des DKFZ; AG
“Statistische Methodik in der klinischen Forschung”, AG “Statistische
Auswertungssysteme”, GMDS / AG “Computational Statistics”,
Deutsche Region der Intern. Biometrischen Gesellschaft; C.
Ortseifen, URZ Universität Heidelberg; L. Hothorn, LG Bioinformatik,
Universität Hannover; N. Victor, Institut für Med. Biometrie
und Informatik, Universität Heidelberg; Akademie für
Weiterbildung, Universität Heidelberg.
Die Einheit bietet im Rahmen ihres Serviceprogramms Dienstleistungen
zur Unterstützung der experimentellen Abteilungen
des DKFZ bei Planung, Durchführung und Auswertung
von Experimenten. Dies umfasst die Beratung bei
Versuchsanträgen unter Berücksichtigung formaler Kriterien
der Versuchsplanung und eines optimalen Informationsgewinns
und die Übernahme der biometrischen Planung
bei Tierversuchen einschließlich der Ausarbeitung einer
schriftlichen Anlage zur biometrischen Begründung der Tierzahlen
und des Versuchsplans. So wurden
in 2002 15 biometrische Versuchspläne und
in 2003 19 biometrische Versuchspläne
ausgearbeitet. Die angebotenen Dienstleistungen schließen
die Beratung von zahlreichen DKFZ-Doktoranden/Innen ein.
Das Labor für ‘Computational‘ Statistik und Datenanalyse
hat die Funktion, die erforderliche Infrastruktur sowie Hardund
Software bereitzustellen. Darin werden auch die Informationen
für Beratungsaufgaben gesammelt und Forscher
des DKFZ zur selbständigen Auswertung ihrer Versuchsergebnisse
angeleitet. Die Themenschwerpunkte waren Softwareevaluierung,
Datenbank-Management und Ausbildung.
Software-Entwicklung und -Evaluierung: Das Statistiksystem
ADAM wurde auf der Grundlage von Benutzeranforderungen
in seinem Funktionsumfang erweitert und der Bedienungskomfort
der Dateneingabe und der grafischen Darstellungen
weiter verbessert. Darüber hinaus wurden für
den Benutzer nicht direkt sichtbar Verbesserungen beim
Rechenaufwand vorgenommen. Die so erhöhte Benutzerfreundlichkeit
hat wesentlich zu einer breiteren Nutzung
im DKFZ geführt.
Datenbank-Management: Für die vermehrt durch die ZE
Biostatistik betreuten klinischen Studien ist eine adäquate
Datenhaltung unerlässlich. Ein Bereich des statistischen Labors
beschäftigte sich daher mit der Qualitätssicherung statistischer
Daten bei Dateneingabe und Datenbankverwaltung.
Die Programmierumgebung von ACCES und EXCEL
wurde verwendet, um schnell und effizient problemgerechte
Prozeduren zu entwickeln. Damit liegt eine wichtige
kostengünstige Alternative zum Statistischen Programmpaket
SAS, das aus finanziellen Gründen nur in einzelnen Modulen
zentral am DKFZ verfügbar ist, vor.
Ausbildung: Kurse zu Grundlagen der Statistik, zu statistischen
Methoden und zur Anwendung statistischer Software
hat Forschern und Doktoranden ermöglicht, selbständig
statistische Auswertungen durchzuführen. Fortbildungsveranstaltungen
zu statistischen Methoden werden regelmäßig
angeboten. Daneben wird eine intensive persönliche
Beratung und Hilfestellung bei der Auswahl statistischer
Software und deren Anwendung geboten. Die in der Serviceeinheit
entwickelten Verfahren konnten in einzelnen
experimentellen Projekten direkt angewendet werden wie
z. B. bei der 3-D Auswertung der Lebersegmentierung [35].
C060
Biostatistik
Wir beteiligten uns an einem Projekt der Validierung alternativer
Verfahren zur Prüfung der Toxizität von Substanzen,
die nicht auf Tierversuchen basierten, unter Federführung
von Prof. L. Hothorn (Universität Hannover). Dieses
von der EVCAM initiierte und finanzierte Projekt leistet
einen wesentlichen Beitrag zum Ersatz von Tierversuchen.
Dazu wurden biometrische Verfahren entwickelt, die es
gestatten, für die Ersatzmethoden ein vergleichbares Niveau
von Genauigkeit nachzuweisen und die den unverfälschten
Vergleich der Ergebnisse der Ersatzmethoden mit
den Ergebnissen der herkömmlichen Tierversuche erlauben.
Dies wird ermöglicht durch die Bestimmung von Sensitivität
und Spezifität sowie der Anwendung von
Regressionsverfahren. Insbesondere wurde die ROC-Technik
bei Vorliegen eines Kontinuums quantitativer Daten
benutzt, wenn „cut-off“ Werte zu bestimmen waren. Model
Selektion und Model Validierung bildeten einen weiteren
Schwerpunkt unseres Arbeitspakets und schließlich wurden
Empfehlungen in der Form eines 4-Stufenprogramms
gegeben [30]. Zur statistischen Auswertung toxikologischer
Daten wurden die Rollen des „proof of hazard“ und
des „proof of safety” herausgestellt [24].
Die in Zusammenarbeit mit der Stabsstelle Krebsprävention
durchgeführten Studien zur Kindergesundheit und zum
Rauchverhalten von Kindern der Jahre 1996 bis 2000 wurden
einer ausführlichen Nachbetreuung und Analyse hinsichtlich
des zeitlichen Verlaufs der erhobenen Variablen
und der Wirkung der einmalig vorgenommenen Intervention
(Aufklärungsunterricht über die Schädlichkeit des Rauchens)
an einer Teilpopulation untersucht. Ein intern zugänglicher
Bericht wurde dazu vorgelegt.
Zusätzliche Finanzierung durch: ECVAM- EU-Projekt shared cost
action, Partner: Universität Hannover
Publikationen (Autoren der Biostatistik hervorgehoben)
[1] Beyer K.S., Klauck S.M., Benner A., Poustka F., Poustka
A.: Association studies of the HOPA dodecamer duplication variant
in different subtypes of autism. Am.J.Med.Genet. 114 (1)
110-115, 2002.
[2] Bonora E., Beyer K.S., Lamb J.A., Parr J.R., Klauck S.M.,
Benner A., Paolucci M., Abbott A., Ragoussis I., Poustka A.,
Bailey A.J., Monaco A.P.: Analysis of reelin as a candidate gene
for autism. Mol.Psychiat. 8 (10) 885-892, 2003.
[3] Breitkreutz I., Benner A., Möhler T., Glasmacher A., Martin
H., Hölzer M., Salwender H., Ho A.D., Goldschmidt H.: Initial
therapy with thalidomide in multiple myeloma: no increase of adverse
events compared to standard therapy. Onkol. 26(S5),
p.127 (P705), 2003.
[4] Breitkreutz I., Cremer F.W., Benner A., Raab M.S.,
Moehler T., Christensen O., Herrmann D., Ho A.D., Goldschmidt
H.: Peripheral blood stem cell collection (PBSC) after CAD plus G-
CSF in multiple myeloma: no influence of previous thalidomide
(THAL) administration. Onkol. 25(S4), pp.211-212 (748), 2002.
[5] Breitkreutz I., Cremer F.W., Benner A., Raab M.S., Möhler
T., Christensen O., Herrmann D., Ho A.D., Goldschmidt H.: Peripheral
blood stem cell collection after CAD plus G-CSF in multiple
myeloma: no influence of previous thalidomide administration.
Onkol. 26(S5), p.131 (P718), 2003.
[6] Breitkreutz I., Glasmacher A., Cremer F.W., Benner A.,
Imbach U., Herrmann D., Ho A.D., Goldschmidt H.: Peripheral
blood stem cell (PBSC) collection in the treatment of multiple myeloma
(MM): influence of VAD and VID. Onkol. 25(S4), p.211
(747), 2002.
[7] Buchholz E., Drings P., Braun L., Meurer S., Pilz L.,
Manegold C.: Standard (SCT) versus dose-intensified chemotherapy
(ICT) with sequential re-infusion of peripheral blood cells
(PBC) in SCLC. J.Cancer Res.Clin.Oncol. 128(Suppl.1), p.76
(P386), 2002.
DKFZ 2004: Wissenschaftlicher Ergebnisbericht 2002 - 2003
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