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MDCK-MRP2 - Dkfz

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Forschungsschwerpunkt B<br />

Funktionelle und Strukturelle Genomforschung<br />

[15] J. Wiemer, F. Schubert, M..Granzow, T. Ragg, J. Fieres, J.<br />

Mattes, R. Eils (2003) Informatics United: exemplary studies<br />

combining medical informatics, neuroinformatics and<br />

bioinformatics. Methods Inf Med. 42:126-33.<br />

[16] F. Schubert, J. Müller, B. Fritz, P. Lichter, R. Eils (2003) Understanding<br />

the Classication of Tumors with a Support Vector Machine:<br />

A Case-Based Explanation Scheme. Proceedings of the<br />

German Conference on Bioinformatics 2003, Garching, Oct 12-<br />

14, 2003. pp. 123-127.<br />

[17] O. Schmidt-Kittler, T. Ragg, A. Daskalakis, M. Granzow, A.<br />

Ahr, T.J.F. Blankenstein, M. Kaufmann, J. Diebold, H. Arnholdt, P.<br />

Müller, J. Bischoff, D. Harich, G. Schlimok, G. Riethmüller, R. Eils,<br />

and C.A. Klein (2003). From latent disseminated cells to overt<br />

metastasis: Genetic analysis of systemic breast cancer progression.<br />

Proc. Natl. Acad. Sci USA, 100:7737-42.<br />

[18] J. Gotter, B. Brors, M. Hergenhahn and B. Kyewski . Medullary<br />

epithelial cells of the human thymus express a highly diverse<br />

selection of tissue-specific genes colocalized in chromosomal clusters.<br />

J. Exp. Med. 199:155-166.<br />

[19] R. König and R. Eils (2004) Gene expression analysis on<br />

biochemical networks with the potts spin model. Bioinformatics, in<br />

press.<br />

[20] S. Bulashevska, O. Szakacs, B. Brors, R. Eils and G. Kovacs<br />

(2004) Pathways of urothelial cancer progression suggested by<br />

Bayesian network analysis of allelotyping data. Int. J. Cancer, in<br />

press.<br />

[21] R. König, D. Baldessari, N. Pollet, C. Niehrs and R. Eils<br />

(2004). Reliability of gene expression ratios for cDNA<br />

microarrays in multi-conditional experiments with a reference design,<br />

Nucleic Acids Res., 32, e29.<br />

Patente<br />

[22] R. Eils, P. Lichter, T. Ragg et al. (2002) An Expert System<br />

for Clinical Outcome Prediction. European Patent pending.<br />

Europäische Patentanmeldung 02 01 7411.6<br />

[23] B. Brors, N. Hauser, M. Vingron (2002) Method and system<br />

for determining absolute mRNA quantities (WO03083127).<br />

Europäische Patentanmeldung EP 2002 00 07 267<br />

Internationale Patentanmeldung WO 2003 EP 03291 2003 0328<br />

[24] R. Eils, B. Brors, T. Haferlach, C. Schoch, S. Schnittger, S.<br />

Mergenthaler, A. Kohlmann, W. Kern, M. Dugas (2002) Novel Genetic<br />

Markers for Leukemias (WO03039443).<br />

Europäische Patentanmeldung 2001 01 126 244.1<br />

Internationale Patentanmeldung WO 2002 EP 12303 2002 1104<br />

Dissertationen:<br />

[25] D. Gerlich (2002) Dynamics of nuclear architecture investigated<br />

by live cell microscopy and quantitative 4D reconstruction.<br />

Dissertation, Universität Heidelberg.<br />

[26] C. Athale (2003) Modelling Nuclear Body Dynamics in Living<br />

Cell by 4-D Microscopy, Image Analysis and Simulation. Dissertation,<br />

Universität Heidelberg.<br />

Abteilung B080<br />

Theoretische Bioinformatik<br />

DKFZ 2004: Wissenschaftlicher Ergebnisbericht 2002 - 2003<br />

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