APPUNTI DI SEMEIOTICA - Istituto Comprensivo "G. Palatucci"

Giordano Perin; meeting markers tumorali
serie di oligonucleotidi fissati e compatibili in modo univoco con
SEQUENZE DI DNA PROVENIENTI DA SPECIFICI GENI: per ciascun gene
sono poste a distanza ravvicinata sul chip da 3 a 10 sequenze
oligonucleotidiche identiche.
• Una volta posto il campione sul chip si lava il chip stesso eliminando tutte
le sequenze colorate che non siano risultate compatibili o che, per ragioni
di competizione, non si siano associate agli oligonucleotidi fissati.
• La lettura del campione viene eseguita quindi in questo modo:
◦ prima viene valutata la presenza di sequenze di DNA associate al
colorante della cellula sana.
◦ Quindi viene valutata la presenza di sequenze di DNA associate al
colorante della cellula neoplastica.
Le due letture vengono quindi sovrapposte per fornire il risultato.
Generalmente si utilizzano:
• un fluorocromo VERDE per la cellula sana.
• Un fluorocromo ROSSO per la cellula malata.
Le possibilità sono quindi tre sulla base della diversa concentrazione dei DNA di
pertinenza delle due cellule:
• se il gene è espresso solo o principalmente dalla cellula sana, le
sequenze compatibili con esso saranno di colore verde.
• Se il gene è espresso solo o principalmente dalla cellula tumorale, le
sequenze compatibili con esso saranno di colore rosso.
• Se l'espressione del gene è invece uguale o simile tra le due cellule, le
sequenze compatibili con esso saranno di colore giallo.
Quanto rilevato:
• viene rappresentato su un grafico sul quale si possono ritrovare
distribuite le diverse colorazioni rossa verde e gialla.
• A distanza di tempo è possibile eseguire nuovamente l'analisi in
questione e determinare se vi siano state delle modifiche: per esempio
una cellula è tanto più aggressiva tanto meno il suo fenotipo viene
influenzato dalla attività di un farmaco chemioterapico.
• Tutto si valuta in ogni caso su GENI DI RIFERIMENTO CHE SONO
CONSIDERATI STABILI.
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